Une équipe de scientifiques menée par le professeur Toshihisa ISHIKAWA du RIKEN Omics Science Center de Yokohama au Japon vient récemment de développer une technique ultra rapide de diagnostic capable notamment de détecter le nouveau virus grippal A (H1N1) en moins de 40
minutes (
Forme première d'un document :
Droit : une minute est l'original d'un acte.
Cartographie géologique ; la minute de terrain est la carte...), soit 100 fois plus rapidement que les examens classiques.
Apparu en avril 2009 au Mexique et aux Etats-Unis, le virus de la grippe A (H1N1) résulte d'un réassortiment d'éléments génétiques de plusieurs virus connus d'origines porcine, humaine et aviaire. Il possède à la
surface (Il existe de nombreuses acceptions au mot surface, parfois objet géométrique, parfois frontière physique, souvent abusivement confondu avec sa mesure - l'aire ou la...) de son enveloppe deux types de protéine nommés
hémagglutinine (L’hémagglutinine (HA) est une glycoprotéine antigénique présente à la surface du virus de la grippe, et est responsable de la fixation de la particule virale à un récepteur situé sur la cellule cible. Le nom...) 1 (H1) et neuraminidase 1 (N1) permettant notamment la fixation et la libération du virus au sein de la cellule cible. Provoquant des symptômes similaires à ceux de la grippe saisonnière, le virus peut cependant donner lieu à des complications sévères entraînant, selon la
gravité (La gravitation est une des quatre interactions fondamentales de la physique.) des cas, l'utilisation d'un traitement antiviral.
La
technologie (Le mot technologie possède deux acceptions de fait :) RT-SmartAmp développée par les chercheurs du RIKEN Omics
Science (La science (du latin scientia, connaissance) relève Historiquement de l'activité philosophique, et fut pendant longtemps un exercice spéculatif visant à élucider les mystères du monde par l'exercice de la raison. À la...) Center, dérive de la très récente technique Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplication (RT-LAMP) permettant d'obtenir notamment l'
amplification (On parle d'amplificateur de force pour tout une palette de systèmes qui amplifient les efforts : mécanique, hydraulique, pneumatique, électrique.) rapide d'un
échantillon (De manière générale, un échantillon est une petite quantité d'une matière, d'information, ou d'une solution. Le mot est utilisé dans différents domaines :) de matériel génétique grâce à l'utilisation de six amorces et à l'application d'une
température (La température d'un système est une fonction croissante du degré d'agitation thermique des particules, c'est-à-dire de son énergie thermique. Elle est définit par l'équilibre de transfert de chaleur avec...) constante (60-65°C). La RT-SmartAmp est une méthode associant l'amplification génétique à température constante et la technique SmartAmp classiquement employée pour détecter les polymorphismes nucléotidiques. L'application de ces deux technologies confère à la RT-SmartAmp une grande rapidité et une grande précision. L'emploi d'une amorce fluorescente spécifique d'un sous-type de virus, dans cette étude A (H1N1), limite les risques de fausse réaction avec d'autres types et sous types viraux (A (H3N2), A (H5N1), B...).
Afin de valider l'efficacité de la RT-SmartAmp, les scientifiques ont effectué une étude comparative des méthodes de
diagnostic (Le diagnostic (du grec δι?γνωση, diágnosi, à partir de δια-, dia-, „par, à travers, séparation,...) en étudiant des prélèvements rhino-pharyngés de patients souffrant de symptômes grippaux entre le
mois (Le mois (Du lat. mensis «mois», et anciennement au plur. «menstrues») est une période de temps arbitraire.) d'octobre 2009 et le mois de janvier 2010. Parmi les 255 échantillons cliniques, la grippe A(H1N1) a été détectée chez 140 patients (54,9% des cas) grâce à la RT-SmartAmp. Dans 72,8% des cas, la technique RT-SmartAmp a permis la détection du virus pandémique 24
heures (L'heure est une unité de mesure :) avant l'apparition de fièvre.
La méthode classique RRT-PCR n'a permis de détecter que 110 cas avérés (43,1%), démontrant ainsi les plus grandes précisions, spécificité et rapidité de la technique RT-SmartAmp. Le protocole opératoire complet de cette technique de diagnostic, déjà considérée par certains scientifiques comme la nouvelle référence, a été publié dans la revue
scientifique (Un scientifique est une personne qui se consacre à l'étude d'une science ou des sciences et qui se consacre à l'étude d'un domaine avec la rigueur et les méthodes scientifiques.) PloSONE datée du 25 janvier 2012.