Introduction
Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données du site internet du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Le NCBI fait partie de la National Library of Medicine (NLM), qui est elle-même un département des National Institutes of Health (NIH) du gouvernement des États-Unis.
Genbank
Article principal : GenBank
Bases de Données
Entrez permet de faire une recherche globale ou filtrée dans les bases de données suivantes:
- All Databases: recherche dans toutes les bases de donnée ci dessous
- NCBI web site: NCBI web and FTP web sites
- PubMed: litterature scientifique et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (abstracts). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur.
- Protein: recherche de séquences
- Nucleotide: recherche de séquences (GenBank)
- EST: Expressed Sequence Tags database
- GSS: Genome Survey Sequences Database
- Structure: structures macromoléculaires en 3D
- Genome: séquences complètes Mapping
- BioSystem": voies métaboliques
- Books: livres en ligne
- CancerChromosomes: aberrations cytogénétique des cancers
- Conserved domains: domaine conservés des protéines
- 3D Domains: domaines en 3D
- Genes: genes
- Genome Project: informations issues du human genome project
- dbGAP: genotypes et phenotypes (database of Genotypes and Phenotypes)
- GENSAT: atlas d'expression de genes du systeme nerveux central de souris
- GEO Profiles: profil d'expression de genes
- HomoloGene: groupes eukariotes homologues
- Journals: titres et caractéristiques des journaux médicaux et scientifiques
- MeSH: Catalogue des mots clés
- NLM Catalog: données bibliographiques de la librairie Nationale de Médecine américaine (NLM)
- OMIM: transmission mendelienne chez l'homme
- OMIA: transmission mendelienne chez l'animal
- Peptidome: données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse en tandem
- PMC: Pubmed Central, sous ensemble de Pubmed ne comportant l'intégralité des articles accessibles librement
- PopSet: données sur l'étude des populations (epidemiologie)
- Probe: séquences spécifiques
- Protein cluster:
- PubChem BioAssay: bioactivité des substances chimiques
- PubChem Compound: activité biologique et structure chimique de composés uniques
- PubChem Substance: activité biologique et structure chimique de composés complexes
- SNP: polymorphismes nucleotidiques simples
- SRA: données issues du séquençage de dernière génération (Short Read Archive (SRA))
- Taxonomy: organismes dans GenBank Taxonomie
- UniGene: groupe de séquence transcrite issues d'un même gène
- UniSTS: séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues