Réparation et mutation: une protéine à double rôle

Publié par Adrien le 08/04/2021 à 09:00
Source: CNRS
Toutes les bactéries, à l'aide d'une protéine spécialisée, sont capables de réparer efficacement les lésions UV que subit leur ADN. Cependant, cette protéine nommée Mfd joue un autre rôle et entraîne des mutations. Une équipe impliquant des scientifiques du CNRS (Le Centre national de la recherche scientifique, plus connu sous son sigle CNRS, est le plus grand...), de l'ENS-PSL et soutenue par l'Inserm a mis en évidence et décrit ce phénomène. Mieux comprendre les mutations ouvre des perspectives dans la lutte contre les résistances aux antibiotiques et aux anti-cancéreux. Cette étude est publiée dans PNAS la semaine du 5 avril 2021.


Vue schématique des processus de réparation ou mutagénèse.
(A) Fonction réparation de Mfd. 1. Une ARN polymérase (Les polymérases (nom tiré de polymère) (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) sont des enzymes qui...) est bloquée par un dégât UV dans l'ADN. 2. Mfd se lie à l'ARN polymérase et à l'ADN, et se déplace le long de l'ADN jusqu'à chasser l'ARN polymérase de l'ADN. 3. En chassant l'ARN polymérase, l'ARN est libéré et Mfd poursuit sa route (Le mot « route » dérive du latin (via) rupta, littéralement « voie...).
(B) Fonction mutagénèse de Mfd. 1. Lorsqu'une ARN polymérase parcourt l'ADN pour lire ses inscriptions, cela provoque l'accumulation de torsades gauches devant la protéine (Une protéine est une macromolécule biologique composée par une ou plusieurs...) et des torsades droites derrière la protéine. 2. Lorsque Mfd interagit avec une ARN polymérase active et se lie à l'ADN, les torsades droites sont concentrées dans la petite zone entre Mfd et l'ARN polymérase, provoquant un déroulement de l'ADN. L'ARN peut alors s'insérer dans la double hélice (Hélice est issu d'un mot grec helix signifiant « spirale ». Un objet en forme...) et former un hybride (En génétique, l'hybride est le croisement de deux individus de deux variétés,...) ADN:ARN, le R-loop.
© Terence Strick.

L'ADN peut subir de nombreuses dégradations incluant celles par les rayons UV. Tout (Le tout compris comme ensemble de ce qui existe est souvent interprété comme le monde ou...) comme un éboulement de terrain sur une voie de chemin de fer (Le chemin de fer est un système de transport guidé servant au transport de personnes et...) empêchera un train (Un train est un véhicule guidé circulant sur des rails. Un train est composé de...) de passer (Le genre Passer a été créé par le zoologiste français Mathurin Jacques...), les dégâts générés par les rayons UV constituent un obstacle à l'ARN polymérase, une protéine qui parcourt la longueur (La longueur d’un objet est la distance entre ses deux extrémités les plus...) d'un ADN pour lire ses instructions. Or, l'ARN polymérase bloquée sur un dégât empêche la réparation de ce dernier. Pour remettre "la voie" en état, les bactéries possèdent une protéine appelée Mfd qui déblaie l'ARN polymérase bloquée, puis recrute d'autres protéines pour aider à la réparation, évitant l'apparition de mutations.

Des biologistes de l'Institut (Un institut est une organisation permanente créée dans un certain but. C'est...) de biologie (La biologie, appelée couramment la « bio », est la science du vivant....) de l'ENS (CNRS / ENS - PSL / Inserm) viennent de mettre en évidence un rôle jusque-là moins connu de cette protéine. En effet, elle est impliquée dans la formation de zones de l'ADN où les mutations apparaissent plus facilement.

La machinerie cellulaire impliquant la protéine Mfd répare normalement l'ADN mais quand une bactérie (Les bactéries (Bacteria) sont des organismes vivants unicellulaires procaryotes, caractérisées...) fait face à certains stress (Le stress (« contrainte » en anglais), ou syndrome général...), comme la présence d'un antibiotique (Un antibiotique (du grec anti : « contre », et bios : « la...), elle emprunte une autre voie: Mfd s'agrippe à une ARN polymérase active en train de parcourir l'ADN, plutôt que de déblayer une ARN polymérase bloquée. Une fois liées, ensemble (En théorie des ensembles, un ensemble désigne intuitivement une collection...) les deux protéines déroulent rapidement et à grande échelle (La grande échelle, aussi appelée échelle aérienne ou auto échelle, est un...) la double hélice d'ADN jusqu'à l'ouvrir. L'ouverture du double brin d'ADN va créer un milieu propice pour la formation de zones particulières facilitant les mutations: les R-loops.

Les R-loops sont des structures encore peu comprises mais elles sont la source de nombreuses mutations: les scientifiques ont montré que près de la moitié des mutations chez les bactéries étaient dues à ces structures. Les résistances aux antibiotiques naissant des mutations, ces travaux, qui démontrent le lien entre Mfd et les R-loops, ouvrent de nouvelles perspectives dans la lutte contre l'antibiorésistance.

L'équipe de recherche (La recherche scientifique désigne en premier lieu l’ensemble des actions entreprises en vue...) souligne également que Mfd a des équivalents dans les diverses branches du vivant et que ce mécanisme de mutation est sans doute universellement présent. Chez l'humain par exemple, l'homologue de la protéine Mfd est impliquée dans le vieillissement (La notion de vieillissement décrit une ou plusieurs modifications fonctionnelles diminuant...) accéléré et également dans certains cancers. Les scientifiques pensent qu'un mécanisme semblable à la formation des R-loops pourrait se produire dans les cellules cancéreuses, introduisant des mutations capables de les rendre résistantes aux traitements.

Bibliographie:
Co-transcriptional R-loop formation by Mfd involves topological partitioning of DNA. James R. Portman, Gwendolyn M. Brouwer, Jack Bollins, Nigel J. Savery, et Terence R. Strick. PNAS, semaine du 5 avril 2021. DOI: 10.1073/pnas.2019630118.
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