La tuberculose d'origine zoonotique révélée avec un nouveau test moléculaire
Publié par Isabelle le 10/11/2019 à 14:00
Source: CNRS INSB

A l'origine de 1.6 million de décès annuels dans le monde, la tuberculose représente la première cause de mortalité due à une maladie infectieuse. Les infections d'origine animale sont largement ignorées dans de nombreux pays (Pays vient du latin pagus qui désignait une subdivision territoriale et tribale d'étendue restreinte (de l'ordre de quelques centaines de km²), subdivision de la civitas gallo-romaine. Comme la civitas qui subsiste le plus...), faute d'identification spécifique de la bactérie (Les bactéries (Bacteria) sont des organismes vivants unicellulaires procaryotes, caractérisées par une absence de noyau et d'organites. La plupart des bactéries possèdent une paroi cellulaire glucidique, le...) incriminée par les tests diagnostiques standards. Une nouvelle étude met en évidence une prévalence insoupçonnée de ces zoonoses chez des patients au Moyen-Orient, révélée par un test moléculaire de nouvelle génération. Ces travaux, menés en collaboration avec l'Université (Une université est un établissement d'enseignement supérieur dont l'objectif est la production du savoir (recherche), sa conservation et sa transmission...) Libanaise, ont été publiés dans The European Respiratory Journal.

L'Organisation (Une organisation est) Mondiale de la Santé (La santé est un état de complet bien-être physique, mental et social, et ne consiste pas seulement en une absence de maladie ou d'infirmité.) (OMS), l'Organisation des Nations Unies pour l'Alimentation (FAO) et d'autres organisations internationales ont appelé à une évaluation mondiale renforcée de la tuberculose (La tuberculose est une maladie infectieuse transmissible et non immunisante, avec des signes cliniques variables. Elle est provoquée par une mycobactérie du...) humaine d'origine zoonotique, causée par la bactérie Mycobacterium bovis. Sa contribution globale à la tuberculose humaine, autrement principalement due à Mycobacterium tuberculosis, pourrait être sous-estimée, en particulier sur les continents où la charge (La charge utile (payload en anglais ; la charge payante) représente ce qui est effectivement transporté par un moyen de transport donné, et qui donne lieu à un paiement ou un bénéfice...) présumée est la plus lourde, c'est-à-dire en Afrique (D’une superficie de 30 221 532 km2 en incluant les îles, l’Afrique est un continent couvrant 6 % de la surface terrestre et 20,3 % de la surface des terres émergées. Avec une...) et en Asie (L'Asie est un des cinq continents ou une partie des supercontinents Eurasie ou Afro-Eurasie de la Terre. Il est le plus grand continent (8,6 % de la surface totale terrestre ou 29,4 % des terres...).

Cette étude met en lumière (La lumière est l'ensemble des ondes électromagnétiques visibles par l'œil humain, c'est-à-dire comprises dans des longueurs d'onde de 380nm (violet) à 780nm (rouge). La lumière est...) une prévalence précédemment insoupçonnée d'infections à M. bovis chez des patients souffrant de tuberculose au Moyen-Orient.M. bovis cause fréquemment des tuberculoses extrapulmonaires difficiles à diagnostiquer. De plus, cette bactérie est naturellement résistante à la pyrazinamide, un antibiotique (Un antibiotique (du grec anti : « contre », et bios : « la vie ») est une molécule qui détruit ou bloque la croissance des bactéries. Dans le premier cas, on...) essentiel pour le traitement antituberculeux standard de courte durée. Les diagnostics les plus couramment utilisés et approuvés par l'OMS ne détectent pas cette résistance et ne différencient pas M. bovis de M. tuberculosis. Les patients infectés par M. bovis risquent donc de recevoir un traitement inadéquat, avec un impact potentiellement négatif sur son efficacité. Le sous-diagnostic chez l'homme (Un homme est un individu de sexe masculin adulte de l'espèce appelée Homme moderne (Homo sapiens) ou plus simplement « Homme ». Par...) implique également l'existence non détectée d'animaux infectés et d'aliments contaminés, telles des produits laitiers non pasteurisés ou de la viande insuffisamment cuite, représentant des risques de zoonoses échappant aux mesures habituelles de lutte contre la maladie (La maladie est une altération des fonctions ou de la santé d'un organisme vivant, animal ou végétal.).

Ces travaux montrent l'existence de cas multiples de tuberculose causés par M. bovis, dans une étude couvrant tous les patients rapportés au programme de lutte contre la tuberculose au Liban sur une période de 18 mois (Le mois (Du lat. mensis «mois», et anciennement au plur. «menstrues») est une période de temps arbitraire.). Ces cas ont été révélés grâce à un nouveau test de dépistage (Le dépistage, en médecine, consiste en la recherche d'une ou de plusieurs maladies ou d'anomalies dites "à risques" chez les individus d'une population donnée. Ces...) moléculaire, appelé Deeplex®-Myc-TB, développé par Genoscreen avec la collaboration de P. Supply. Contrairement aux tests standards, ce test est capable de différencier M. bovis de M. tuberculosis, et de détecter simultanément la résistance à la pyrazinamide, ainsi qu'à douze autres antibiotiques/classes d'antibiotiques, grâce à l'analyse d'un large panel (Le panel est un groupe de personnes interrogées régulièrement sur leurs opinions ou leurs attitudes. Les personnes peuvent participer aux enquêtes par courrier, téléphone ou, de plus en plus souvent, via...) de gènes cibles de ces bactéries. Ces résultats peuvent être obtenus en seulement un à trois jours (Le jour ou la journée est l'intervalle qui sépare le lever du coucher du Soleil ; c'est la période entre deux nuits, pendant laquelle les rayons du Soleil...), au lieu des semaines nécessaires aux tests de culture (La définition que donne l'UNESCO de la culture est la suivante [1] :).

Ce test permettra donc de remédier à la sous-détection de cas de zoonoses, ainsi que des multirésistances aux antibiotiques de nombreuses autres souches de tuberculose, permettant une définition (Une définition est un discours qui dit ce qu'est une chose ou ce que signifie un nom. D'où la division entre les définitions réelles et les définitions nominales.) bien plus rapide et plus appropriée du traitement des patients, ainsi qu'un meilleur dépistage des sources d'infection.


© Genoscreen, LilleFigure: Identification par le test moléculaire Deeplex®-MycTB d'une souche de M. bovis isolée d'un patient souffrant de tuberculose au Liban. Le secteur en rouge (La couleur rouge répond à différentes définitions, selon le système chromatique dont on fait usage.) indique une mutation spécifique de M. bovis conférant une antibiorésistance à la pyrazinamide. Au centre, les informations de typage moléculaire identifiant (En informatique, on appelle identifiants (également appelé parfois en anglais login) les informations permettant à une personne de s'identifier...) la souche.

Pour en savoir plus:
Zoonotic tuberculosis in humans assessed by next-generation sequencing: an 18-month nationwide study in Lebanon.
El Achkar S, Demanche C, Osman M, Rafei R, Ismail MB, Gaudin C, Duthoy S, De Matos F, Yaacoub H, Pinçon C, Hamze M, Supply P.
Eur Respir J. 2019 Sep 26. pii: 1900513. doi: 10.1183/13993003.00513-2019. [Epub ahead of print] No abstract.

Contact chercheur:
Philip Supply
Chercheur CNRS (Le Centre national de la recherche scientifique, plus connu sous son sigle CNRS, est le plus grand organisme de recherche scientifique public français (EPST).) au Centre d'infection et d'immunité de Lille (CIIL) - (CNRS, Inserm, Université de Lille, Institut Pasteur (L’Institut Pasteur est une fondation française privée à but non lucratif qui se consacre à l'étude de la biologie, des microorganismes, des maladies et des...) de Lille)
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