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La biologie structurale se concentre sur la compréhension des structures moléculaires des matériaux biologiques, comme les protéines et les acides nucléiques. AlphaFold3 va au-delà de ses prédécesseurs en offrant une précision accrue dans la prédiction des interactions entre protéines et autres biomolécules, telles que l'ADN et l'ARN.
AlphaFold3 permet aux chercheurs de mieux comprendre les mécanismes moléculaires fondamentaux de la vie. En prédisant comment les protéines se lient et interagissent avec d'autres molécules biologiques, il ouvre la voie à des innovations dans divers domaines. Par exemple, dans l'agriculture, AlphaFold3 pourrait aider à développer des cultures plus résistantes. Dans le domaine médical, il pourrait accélérer la découverte de nouveaux médicaments.
Une étude publiée dans Nature le 8 mai souligne que le programme peut prédire les interactions non seulement entre grandes molécules comme les protéines, mais aussi avec des petites molécules appelées ligands. Ces ligands jouent un rôle crucial en se liant à des récepteurs sur les protéines, un peu comme une clé s'insère dans une serrure. AlphaFold3 peut également modéliser les modifications chimiques de ces biomolécules, lesquelles peuvent être impliquées dans des maladies.
Les chercheurs affirment qu'AlphaFold3 est 50 % plus précis que les méthodes actuelles pour prédire les structures protéiques et leurs interactions. En recherche pharmaceutique, AlphaFold3 a surpassé des programmes de docking existants et RoseTTAFold All-Atom, un réseau neuronal pour la prédiction des structures biomoléculaires. Frank Uhlmann, biochimiste à l'Institut Francis Crick de Londres, utilise AlphaFold3 pour prédire les structures des protéines interagissant avec l'ADN, avec des résultats majoritairement exacts.
Toutefois, AlphaFold3 n'est plus open source, limitant ainsi l'accès des scientifiques au code et aux données d'entraînement du modèle. Pour la recherche non commerciale, les chercheurs peuvent utiliser le serveur AlphaFold, lancé récemment. Ce service gratuit permet de soumettre des séquences moléculaires et de recevoir des prédictions en quelques minutes, bien que limité à 20 tâches par jour.
AlphaFold3 représente un pas de géant dans la biologie structurale et ouvre de nouvelles perspectives pour la recherche scientifique et médicale. Son potentiel pour révolutionner la compréhension des interactions biomoléculaires est immense, promettant des avancées significatives dans divers domaines.