SRAS-CoV-2: mesurer l'ARN viral pour savoir quels patients vont mourir

Publié par Isabelle le 29/11/2021 à 13:00
Source: Université de Montréal

Crédit: Getty
Dans une étude publiée dans Science Advances, l'équipe du chercheur et médecin Daniel Kaufmann, professeur au Département de médecine de l'Université de Montréal, montre que la quantité de matériel génétique (La génétique (du grec genno γεννώ = donner naissance) est...) du SRAS-CoV-2 circulant dans le sang (Le sang est un tissu conjonctif liquide formé de populations cellulaires libres, dont le...) - l'ARN viral - est un indicateur fiable pour reconnaître les patients susceptibles de mourir de la COVID-19.

Malgré les progrès de la prise en charge (La charge utile (payload en anglais ; la charge payante) représente ce qui est effectivement...) de la maladie (La maladie est une altération des fonctions ou de la santé d'un organisme vivant, animal...), désigner les patients les plus à risque d'en décéder demeure difficile pour les médecins et cela les empêche de leur proposer de nouveaux traitements.

De nombreux biomarqueurs ont pourtant été mis au jour (Le jour ou la journée est l'intervalle qui sépare le lever du coucher du Soleil ; c'est la...) dans la littérature scientifique (Un scientifique est une personne qui se consacre à l'étude d'une science ou des sciences et qui...) récente. Mais jongler avec un tel foisonnement de paramètres est impossible en clinique et nuit à une prise de décisions médicales rapides.

"Dans notre étude, nous avons pu déterminer quels biomarqueurs sont prédictifs de la mortalité dans les 60 jours suivant l'apparition des symptômes de la maladie. Grâce à nos données (Dans les technologies de l'information (TI), une donnée est une description élémentaire, souvent...), nous avons réussi à concevoir, puis à valider un modèle statistique (Une statistique est, au premier abord, un nombre calculé à propos d'un échantillon....) basé sur un seul marqueur sanguin", dit le Dr Kaufmann, coauteur principal avec Nicolas Chomont et Andrés Finzi, deux autres chercheurs du Centre de recherche (La recherche scientifique désigne en premier lieu l’ensemble des actions entreprises en vue...) du CHUM (CRCHUM).

Un cocktail de trois paramètres

À partir de prélèvements sanguins sur 279 patients hospitalisés pour une forme de la COVID-19 allant de modérée à critique, l'équipe du Dr Kaufmann a mesuré les quantités de protéines inflammatoires et les équipes de Nicolas Chomont et d'Andrés Finzi les quantités d'ARN viral et les taux d'anticorps ciblant le virus (Un virus est une entité biologique qui nécessite une cellule hôte, dont il utilise...) respectivement. Les échantillons ont été recueillis 11 jours après l'apparition des symptômes et les patients ont été suivis pendant 60 jours au minimum après cette période.

L'hypothèse des scientifiques ? Vérifier si ces indicateurs immunologiques étaient associés à une augmentation de la mortalité.

"Parmi tous les biomarqueurs évalués, nous montrons que la quantité (La quantité est un terme générique de la métrologie (compte, montant) ; un scalaire,...) d'ARN viral dans le sang est directement associée à la mortalité et donne la meilleure réponse (En théorie des jeux, la meilleure réponse est la stratégie ou l'ensemble de...) prédictive une fois notre modèle ajusté en fonction de l'âge et du sexe (Le mot sexe désigne souvent l'appareil reproducteur, ou l’acte sexuel et la...) de la personne malade. Nous avons même constaté que l'ajout de biomarqueurs supplémentaires n'améliore pas la qualité prédictive", explique Elsa Brunet-Ratnasingham, doctorante au laboratoire du Dr Kaufmann et copremière auteure de l'étude.

Un modèle puissant


Daniel Kaufmann et Elsa Brunet-Ratnasingham Crédit: CRCHUM
Pour confirmer l'efficacité de leur modèle, Daniel Kaufmann et Elsa Brunet-Ratnasingham, lauréate d'une bourse d'excellence COVID-19 (UdeM), l'ont mis à l'essai auprès de deux cohortes indépendantes de patients infectés issues de l'Hôpital (Un hôpital est un lieu destiné à prendre en charge des personnes atteintes de...) général juif de Montréal (Montréal est à la fois région administrative et métropole du Québec[2]. Cette grande...) (première vague (Une vague est un mouvement oscillatoire de la surface d'un océan, d'une mer ou d'un lac. Les...) de la pandémie) et du CHUM (deuxième et troisième vagues). Qu'importe l'hôpital de prise en charge initiale et la période de la pandémie (Une pandémie (du grec ancien πᾶν / pãn (tous) et...) considérée, le modèle prédictif fonctionne.

Selon le Dr Kaufmann, "il serait intéressant d'utiliser le modèle pour suivre les patients et de se poser la question suivante: la charge virale reste-t-elle un marqueur prédictif de mortalité quand on administre de nouveaux traitements qui ont prouvé leur efficacité?"

La question ouvre la voie à de futurs (Futurs est une collection de science-fiction des Éditions de l'Aurore.) travaux de recherche.

À propos de l'étude

L'article "Integrated immunovirological profiling validates plasma ( En physique, le plasma décrit un état de la matière constitué de particules chargées...) SARS-CoV-2 RNA as an early predictor of COVID-19 mortality", par Elsa Brunet-Ratnasingham, Sai Priya Anand, Pierre Gantner, Alina Dyachenko et leurs collègues, a été publié le 26 novembre 2021 dans Science (La science (latin scientia, « connaissance ») est, d'après le dictionnaire...) Advances.

Le financement de l'étude a été assuré par le Groupe de travail sur l'immunité face à la COVID-19, les Instituts de recherche en santé (La santé est un état de complet bien-être physique, mental et social, et ne consiste...) du Canada, l'American Foundation for AIDS Research, la Fondation canadienne pour l'innovation, le ministère de l'Économie et de l'Innovation du Québec, la Fondation du CHUM, le Fonds de recherche du Québec – Santé, Génome (Le génome est l'ensemble du matériel génétique d'un individu ou d'une...) Québec et l'Agence de la santé publique (La santé publique peut être définie de diverses manières. On peut en effet la...) du Canada.

Centre:
Centre de recherche du CHUM
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