Par Valérie Lannoy, post-doctorante en microbiologie, Sorbonne Université
Il est difficile de faire nos courses sans qu'il ne nous soit proposé des produits pour protéger notre microflore ! Notre corps hébergerait dix fois plus de bactéries que de cellules. Vraiment ?

Notre systÚme digestif contient énormément de bactéries.
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La microflore ou microbiote est l'ensemble des micro-organismes qui résident normalement dans notre corps. Ses secrets ont été vulgarisés par la Dre Giulia Enders dans son livre "Le charme discret de l'intestin".
Ce best-seller a largement contribuĂ© Ă l'engouement autour du sujet ! Pourtant, la dĂ©couverte de la microflore intestinale a plus d'un siĂšcle. Nous la devons au microbiologiste Ălie Metchnikoff, prix Nobel de mĂ©decine en 1908. Avec le temps, les avancĂ©es technologiques ont facilitĂ© l'Ă©tude du microbiote, et c'est en 1977 que le cĂ©lĂšbre ratio d'une cellule humaine pour dix bactĂ©ries est publiĂ© par le microbiologiste amĂ©ricain Dwayne Savage.
Des quantités de microbes et de cellules difficilement mesurables
En 1972, le biochimiste Thomas Luckey a Ă©valuĂ© que chaque gramme de selles humaines renfermait cent milliards de bactĂ©ries et que l'appareil digestif en contenait un kilo. En multipliant, et en considĂ©rant que la majoritĂ© des bactĂ©ries se loge dans les fĂšces, l'estimation de la quantitĂ© dans le corps Ă©tait donc de 100 000 milliards de bactĂ©ries. En 1977, l'Ă©quipe du Pr Savage a ramenĂ© ce nombre sur le nombre de cellules humaines (10 000 milliards), d'oĂč le fameux ratio. Ce rapport d'un sur dix s'est vite rĂ©pandu dans la communautĂ© scientifique, car il est facile Ă retenir et rend concrĂšte la notion de microflore intestinale. Le ratio est encore diffusĂ© dans les cours de biologie ou activitĂ©s de vulgarisation.
PrÚs de quarante ans aprÚs, en 2014, le microbiologiste Judah Rosner a publié une lettre dans l'ancien journal scientifique "Microbe" pour questionner l'intangible proportion d'un sur dix. Le début de son texte est d'ailleurs intéressant et révÚle un paradoxe: "La science se régit par une réanalyse critique de faits. [...] Mais une fois qu'un fait entre dans la littérature scientifique, au bout d'un moment, il devient difficile à effacer."
Le Pr Rosner souligne que l'estimation de 10 000 milliards de cellules est d'abord sortie dans un livre en 1970, mais que l'information n'y est pas rĂ©fĂ©rencĂ©e. Il avertit aussi que l'apprĂ©ciation de la quantitĂ© de cellules humaines reprĂ©sente en fait un dĂ©fi. Il conclut que, mĂȘme si le ratio devait ĂȘtre contredit, cela ne remettrait pas en cause l'implication du microbiote dans la santĂ© humaine.
Une question de méthode
Deux ans aprÚs la lettre mentionnée, des travaux israéliens ont démenti l'inébranlable ratio. L'équipe du Professeur Ron Milo a sélectionné l'organe dont le nombre de bactéries était représentatif des bactéries dans l'organisme. La microflore de la bouche, des poumons ou de la peau n'a pas été comptabilisée, car la quantité de bactéries y est cent fois moins riche que dans le gros intestin.
Ils ont pris en compte que le cÎlon contient 400 grammes et non un kilo de selles fraßches. Ensuite, l'équipe s'est inspirée d'un article scientifique italien, qui évaluait le nombre de cellules humaines, non pas de maniÚre globale, mais organe par organe puisque les tailles et masses des cellules sont trÚs variables à travers le corps.
Le nombre de cellules humaines devient alors trois fois plus élevé, soit 30 000 milliards. La proportion de bactéries par cellule est ainsi affinée à 1,3. Bien qu'inférieur à 10, le rapport est supérieur à 1, donc les bactéries restent supérieures en nombre. Néanmoins, chaque fois vous déféquez aux toilettes, il se rééquilibre et ce sont les cellules humaines qui deviennent supérieures en nombre !
Virus, bactéries et protozoaires peuplent notre corps
Nous parlons de bactéries, composante du microbiote intestinal la plus analysée aujourd'hui. Cependant, elle n'exprime pas toute la complexité de votre microflore. Bactéries, levures, protozoaires (animal microscopique à une seule cellule) et virus, voici le petit monde inoffensif que vous hébergez ! Notre "virobiote" a longtemps été considéré comme représentant l'écrasante majorité de l'organisme.
En 2021, des études revoient cette donnée à la baisse, et rapprochent le nombre de virus dans notre corps à celui des bactéries. Par conséquent, ces effectifs sont semblables aux cellules humaines. Mais n'oubliez pas qu'en les additionnant, bactéries et virus groupés ensemble sont majoritaires !