Le premier nom connu de cette maladie fut l’"ulcère serpigineux", terminologie qui date de 1882.
Le terme clinique correct pour désigner la donovanose est granulome inguinal . Le granulome est une réaction inflammatoire de type nodulaire, et le mot inguinal fait référence à la région inguinale, qui est le siège de cette infection. La maladie est communément connue sous le nom de donovanose, d’après les corps de Donovan, qui sont un signe diagnostic. Découvertes par Charles Donovan , ces inclusions intracellulaires représentent des bactéries qui ont été absorbées par des cellules immunitaires nettoyeuses, les phagocytes mononucléés ou histiocytes.
Le micro-organisme responsable, Klebsiella granulomatis , que l'on appelait Calymmatobacterium granulomatis(certaines source utilisent toujours cette nomenclature) , du grec kalymma(un capuchon ou un voile), désignant les lésions qui contiennent des bactéries. Auparavant, il était appelé Donovania granulomatis, en raison des corps de Donovan . Le nom d'espèce granulomatis fait réfèrence aux lésions granulomateuses. Ce micro-organisme a récemment été reclassé dans le genre Klebsiella , un changement taxonomique radical car il implique que le micro-organisme change d’embranchement. Cependant, les techniques de réaction en chaîne par polymérase (PCR), utilisant un système de détection colorimétrique ont montré 99% de similarité avec d'autres espèces du genre Klebsiella.