Philippo Buonanni ou Bonanni (7 janvier 1638, Rome - 30 mars 1725, Rome) est un jésuite, un scientifique et un collectionneur italien.
Il est l'élève d'Athanasius Kircher (vers 1601–1680) au Collegio Romano de Rome. Il entre à la Compagnie de Jésus en 1654. Il succède à Kircher à la mort de celui-ci.
Buonanni est un collectionneur de coquillages et est l'auteur du premier livre consacré uniquement à ces animaux. Il est fait paraître à Rome en 1681 Ricreatione dell' occhio e della mente... qui contient de très nombreuses illustrations de coquillages qui, bien qu'inversés, ont été retenues par Carl von Linné. Mais ses connaissances sur l'anatomie des mollusques sont assez réduites tout comme sa classification moins juste que celle d'Aristote. Même s'il apporte peu de connaissances nouvelles et reproduit les légendes colportées par les auteurs anciens, il défend l'intérêt des collections de coquillages auprès de ses contemporains. Il s'intéresse à la question de la révolution des coquilles ainsi qu'à l'importance économique de ces animaux. Buonanni est un ecclésiastique sans véritable bagage scientifique ni expérience de terrain. Mais son livre est précieux par la compilation des connaissances et les illustrations qu'il offre. Il ne sera supplanté que par les études sur les mollusques de Martin Lister (1639-1712).
Puce représentée par Buonanni (1691).
Il se bat contre les adversaires de la génération spontanée, notamment Francesco Redi. À cette fin, il multiplie les observations faites à l'aide d'un microscope muni de trois lentilles qu'il construit lui-même. Il tente de montrer, par de fines observations, que la génération spontanée est possible chez les animaux sans sang et sans cœur.
Il publie en 1691, Observationes circa Viventia, quae in Rebus non Viventibus reperiuntur. Les illustrations qui illustrent ses différents travaux sont excellentes et prouvent la qualité de ses observations.
Il publie un catalogue du cabinet de curiosités de Kircher hébergé par le Collegio Romano dont il est le conservateur depuis 1698 : Musaeum Kircherianum, sive Musaeum a P.A. Krichero in Collegio Romano Societatis Jesu... descriptum etc. (1709, Rome).
Il est également un collectionneur de médailles et de monnaies sur lesquelles il publie plusieurs ouvrages.