Un diagnostic universel de toutes les maladies infectieuses, connues et inconnues, en un seul test 🧪

L'identification des maladies infectieuses reste souvent une épreuve de patience, entravée par des tests spécifiques limités.

Pourtant, des chercheurs de l'Université de Californie à San Francisco (UCSF) ont démontré qu'un outil unique, basé sur le séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS), pourrait transformer ce paradigme. Contrairement aux tests classiques qui ciblent un pathogène à la fois, cette méthode scrute l'ensemble de l'ADN et de l'ARN contenus dans un échantillon biologique.


L'idée repose sur un principe ingénieux: extraire tout le matériel génétique d'un prélèvement – qu'il s'agisse de sang, de liquide céphalo-rachidien ou respiratoire – et le comparer à une base de données de milliers d'agents pathogènes. En quelques heures, le test est capable d'établir une correspondance précise et de nommer le coupable.

Une étude publiée dans Nature Medicine a exploré l'efficacité de cette approche sur des infections du système nerveux central, telles que l'encéphalite ou la méningite. Entre 2016 et 2023, plus de 4 800 échantillons ont été analysés, permettant de poser un diagnostic précis dans 86 % des cas. Ces pathologies, particulièrement graves, nécessitent une prise en charge rapide pour limiter les risques de complications.

Outre les infections neurologiques, une application complémentaire de la technologie a été testée sur des maladies respiratoires comme la pneumonie. Publiée dans Nature Communications, cette étude a également montré des résultats prometteurs, notamment grâce à l'automatisation du processus. Celle-ci réduit le délai d'analyse, rendant cette méthode encore plus accessible dans les situations d'urgence.

Un autre atout majeur de la technique réside dans sa capacité à détecter des pathogènes jusqu'alors inconnus. Les chercheurs y voient un outil clé pour identifier de potentiels virus à risque pandémique, dans un monde où les bouleversements environnementaux favorisent l'émergence de nouvelles maladies infectieuses.

Cependant, cette innovation soulève des questions d'accès. Actuellement, le mNGS est disponible dans des laboratoires spécialisés comme celui de Delve Bio, société qui commercialise la technologie. Avec des résultats accessibles en deux jours, ce service pourrait devenir une norme pour des cas cliniques complexes.

Alors que les recherches se poursuivent pour étendre les applications du mNGS, cette technologie marque un tournant dans le diagnostic médical. Elle pourrait, dans un avenir proche, complètement modifier la prise en charge des maladies infectieuses, qu'elles soient courantes ou émergentes.

Qu'est-ce que le séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS) ?

Le séquençage métagénomique de nouvelle génération, ou mNGS, est une technique récente en microbiologie médicale. Contrairement aux tests traditionnels qui ciblent un pathogène spécifique, le mNGS analyse tout le matériel génétique – ADN et ARN – contenu dans un échantillon biologique.

Cette méthode fonctionne en comparant les séquences génétiques obtenues avec une immense base de données regroupant des milliers d'agents pathogènes. Cela permet d'identifier de manière précise virus, bactéries, champignons ou parasites présents dans l'échantillon.

L'un des avantages majeurs du mNGS est sa capacité à détecter des pathogènes rares ou inconnus. Cette propriété est essentielle pour repérer rapidement des menaces émergentes, comme de nouveaux virus à potentiel pandémique.

Enfin, l'automatisation du processus rend le mNGS particulièrement rapide, avec des résultats accessibles en quelques heures à quelques jours, ouvrant la voie à des diagnostics et des traitements plus efficaces.