Aves (classification phylogénétique)

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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Aves (ou Oiseaux), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre les différents groupes (ou taxa) d'organismes vivants. Du fait de ses méthodes nouvelles basées notamment sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification uniquement basée sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi certains points particuliers font-ils encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.

Ce cladogramme mentionne aussi bien les groupes encore représentés dans la nature actuelle que ceux qui sont éteints (il inclut donc les groupes fossiles).

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.

▲ └─o Aves └─o Neornithes ├─o Palaeognathae │ ├─o Struthioniformes │ └─o │ ├─o Tinamiformes │ ├─o Rheiformes │ └─o │ ├─o Apterygiformes │ └─o Casuariiformes └─o Neognathae ├─o Galloanserae │ ├─o Galliformes │ └─o Anseriformes └─o Neoaves ├─o Metaves │ ├─o │ │ ├─o │ │ │ ├─o Podicipediformes │ │ │ └─o Phoenicopteriformes │ │ └─o │ │ ├─o Phaethontiformes │ │ └─o │ │ ├─o Pteroclidiformes │ │ └─o │ │ ├─o Mesitornithiformes │ │ └─o Columbiformes │ └─o │ ├─o Eurypygiformes │ └─o Caprimulgiformes (paraphylétique) │ └─o Apodiformes └─o Coronaves ├─o │ ├─o Opisthocomiformes │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Otidiformes │ │ └─o │ │ ├─o Gruiformes │ │ └─o Cuculiformes │ └─o │ ├─o Musophagiformes │ └─o │ ├─o Gaviiformes │ └─o │ ├─o │ │ ├─o Sphenisciformes │ │ └─o Procellariiformes │ └─o │ ├─o Ciconiiformes │ └─o Pelecaniformes └─o ├─o Charadriiformes └─o ├─o │ ├─o Cariamiformes │ └─o │ ├─o Falconiformes │ └─o │ ├─o Passeriformes ► │ └─o Psittaciformes └─o ├─o Accipitriformes └─o ├─o │ ├─o Coliiformes │ └─o Strigiformes └─o ├─o Leptosomiformes └─o ├─o Trogoniformes └─o ├─o Bucerotiformes └─o ├─o Piciformes └─o Coraciiformes

Les origines des Oiseaux et leurs parentés parmi les différentes lignées de Théropodes restent des lieux de débat. On trouvera à la page « Dinosauria (classification phylogénétique) » un autre arrangement de ces différents groupes maniraptoriens que celui présenté dans le cladogramme ci-dessus.

La classification traditionnelle des Oiseaux modernes a été entièrement remise en question par les publications de Charles Sibley, dont la classification est basée sur la comparaison des hybridations de l'ADN. Le clade monophylétique formé, à la base de l'arbre des Néognathes, par les Galliformes et les Ansériformes est aujourd'hui accepté par tous les auteurs. Par contre, en ce qui concerne les Neoaves, sur la base de la classification de Sibley, d'autres analyses plus phylogénétiques en ont remis en cause certains des résultats, notamment sur l'appréciation de l'homologie de certains caractères.

La définition de la plupart des anciens ordres a été modifiée ; les noms d'ordres (en -iformes) portés dans l'arbre sont ceux du Congrès ornithologique international. Le cladogramme présenté ci-dessus suit Hackett et alii 2008.

Classification de Sibley

Sources bibliographiques de référence

John Harshman, Edward L. Braun, Michael J. Braun, Christopher J. Huddleston, Rauri C. K. Bowie, Jena L. Chojnowski, Shannon J. Hackett, Kin-Lan Han, Rebecca T. Kimball, Ben D. Marks, Kathleen J. Miglia, William S. Moore, Sushma Reddy, Frederick H. Sheldon, David W. Steadman, Scott J. Steppan, Christopher C. Witt et Tamaki Yuri : « Phylogenomic evidence for multiple losses of flight in ratite birds », PNAS, vol. 105, n°36, 2008, pp. 13462–13467
Shannon J. Hackett, Rebecca T. Kimball, Sushma Reddy, Rauri C. K. Bowie, Edward L. Braun, Michael J. Braun, Jena L. Chojnowski, W. Andrew Cox, Kin-Lan Han, John Harshman, Christopher J. Huddleston, Ben D. Marks, Kathleen J. Miglia, William S. Moore, Frederick H. Sheldon, David W. Steadman, Christopher C. Witt, Tamaki Yuri : « A phylogenomic study of birds reveals their evolutionary history », Science, vol. 320, n°5884, 2008, pp. 1763-1768
Per G.P. Ericson, Cajsa L. Anderson, Tom Britton, Andrzej Elzanowski, Ulf S. Johansson, Mari Källersjö, Jan I. Ohlson, Thomas J. Parsons, Dario Zuccon et Gerald Mayr : « Diversification of Neoaves : integration of molecular sequence data and fossils », Biol. Lett., 2006
Gavin H. Thomas, Matthew A. Wills et Tamás Székely : « A supertree approach to shorebird phylogeny », BMC Evolutionary Biology 4:28, 2004
Per G.P. Ericson, Ida Envall, Martin Irestedt et Janette A. Norman : « Inter-familial relationships of the shorebirds (Aves : Charadriiformes) based on nuclear DNA sequence data », BMC Evolutionary Biology, 3:16, 2003
Charles Gald Sibley et Jon Edward Ahlquist : Phylogeny and classification of birds. A Study in Molecular Evolution, Yale University Press, 1990, ISBN 978-0300040852

Autres sources bibliographiques

R.S. de Kloet et S.R. de Kloet (2005) « The evolution of the spindlin gene in birds: Sequence analysis of an intron of the spindlin W and Z gene reveals four major divisions of the Psittaciformes ». Molecular Phylogenetics and Evolution 36, pp. 706-721.