En 1144, Jean de Courchamp fait une donation de terres, champs et prés, en présence des seigneurs voisins qui l’approuvent aux frères de la Milice du Temple. En 1167, l’évêque de Langres donne aux frères de la Romagne la moitié de l’église de Saint-Maurice, sans doute le bâtiment, à entretenir, et surtout la moitié du prélèvement qui, sous le nom de dîme, se faisait sur les récoltes de grain et de vin. En 1227, c’est la dame Agnès de Saint-Maurice qui donne aux frères, avec l’accord de ses enfants, Jacques, Laurent et Elisabeth, le four et le moulin du village. En 1191, lors de la troisième croisade, au siège de Saint-Jean d’Acre, Guy de Vergy donne à Dieu et aux frères de la milice du Temple de la Romagne, pour la rédemption de son âme et de celle de ses parents, une portion de terre qu’il possédait près d’Autrey, avec des pâturages et des bois.
La Romagne prend une part importante à l'implantation templière en Franche-Comté.
En 1309, pendant le procès, c'est Regnaut Mignart de Mussy, commis au gouvernement des biens du temple en la baillie de Bures et de la Romagne qui gère le domaine.
À la disparition des Templiers, la Romagne devient une commanderie de l'ordre des Chevaliers de Saint-Jean de Jérusalem. Elle est remaniée et fortifiée à la fin du XV siècle par le commandeur Pierre de Bosredon.