Le projet de créer à Cracovie une école d'ingénieurs a été conçu par le professeur Izydor Stella-Sawicki, qui, au début de l'année 1945 a proposé d'ouvrir dans la ville une école supérieure technique. L'inauguration de la première année académique à l'école technique de Cracovie a eu lieu le 31 mai 1945, les premiers cours ont été donnés le 5 juin 1945.
Par un décret du 19 novembre 1946 sur la création des facultés d'architecture, d'ingénierie et de communication à l'Académie des mines (Akademia Górnicza) avec la date d'entrée en vigueur du 1 avril 1945, ce jour-ci est traditionnellement considéré comme le jour de la création de l'université technique de Cracovie. L'école s'est fait ensuite offrir par l'armée les anciens bâtiments historiques (construits par les Autrichiens) rue Warszawska qui constituent actuellement le campus principal de l'université.
Les démarches ayant pour but de créer une université technique individuelle ont débouché sur un décret du Conseil des ministres n° 409 du 21 juillet 1954 sur la création de la Politechnika Krakowska. L'université abritait alors 4 départements : architecture, deux département d'ingénierie civile, ingénierie mécanique. Dans les années quatre-vingt, le département d'ingénierie mécanique s'est installé dans un campus universitaire nouvellement construit à Czyzyny, là où il y a également aujourd'hui les résidences d'étudiants de la PK.
Le jour de son 30 anniversaire, l'université a reçu le nom de l’ingénieur Tadeusz Kosciuszko, particulièrement lié à l'histoire de la ville de Cracovie.
Les départements suivants ont été créés successivement : en 1966, le département de chimie (à partir du 1990 - le département de technologie et d'ingénierie chimique), en 1991, le département d'ingénierie électrique (à partir du 1997 - le département d'ingénierie informatique et électrique), en 1999, le plus jeune - le département de physique appliquée et de modélisation assistée par ordinateur. En 1993, le département d'ingénierie sanitaire et des eaux s'est transformé en département d'ingénierie de l'environnement.