Ils commencent à étudier les ailes volantes très jeunes, alors qu'ils sont encore à l'école, et sont enthousiastes pour les conceptions de Alexander Lippisch. A cette époque, le Traité de Versailles oblige l'Allemagne à ne pas avoir d'aviation militaire, et ces restrictions regroupent les pilotes dans les aéroclubs, autour de planeurs. En 1933 ils construisent leur premier avion, le Horten I. D'autres modèles suivent, dont les envergures, finesses et flèches d'aile, sont de plus en plus importantes. Epurés au maximum, leurs planeurs étaient d'une efficacité remarquable pour l'époque, avec par exemple, une finesse estimée à 45 pour le Horten VI de 1944. Ce chiffre est le même que celui des planeurs standards d'aujourd'hui, construits à l'aide de matériaux modernes. Une autre de leurs particularité est la position du pilote, semi-allongé sur le ventre, qui pouvait donner au pilote l'impression de voler avec des ailes au bout des bras.
En 1938, ils participent au concours de la Rhön, avec deux ailes Horten III. Un cumulus aspire de nombreux planeurs, qui montent à une altitude de 7500 mètres environ, dont les Horten III. Les deux pilotes engagés par les frères Horten sont contraints de quitter leurs machines. L'un d'eux se tue à l'atterrissage, l'autre est hospitalisé pour cause de gelures.
Pendant la guerre mondiale, Reimar et Walter sont engagés dans la Luftwaffe, mais leurs connaissances n'intéressent pas l'armée. En 1942, ils obtiendront tout de même des aides pour construire le Horten Ho IX, officiellement nommée Gotha Go 229, première aile volante bi-réacteur, à l'apparence futuriste. L'appareil montrera un grand potentiel, mais la défaite allemande, et la confiscation par les Alliés de tous les projets du Reich, le feront sombrer dans l'oubli.
Après la Seconde Guerre mondiale, Reimar Horten part en Argentine, pour l'Institut Aéronautique de Cordoba, alors que son frère reste en Allemagne. Aidé par le pilote d'essai Heinz Scheidhauer, il construit les I.Ae.34 Clen Antu monoplace et biplace, parfois désignées comme les Horten XVa et Horten XVb , puis la I.Ae.41 Urubu, désignée comme le Horten XVc.
Reimar reste en Amérique du Sud jusqu'à sa mort en 1994, et Walter décède en Allemagne en 1998.
Il reste très peu d'ailes Horten, et plus aucune en état de voler. Deux exemplaires restaurés d'un Horten III et un Horten IV sont visibles au National Air and Space Museum de Washington, DC, un Ho IX v3 bi-réacteur est en attente de restauration dans un hangar du musée Planes of Fame de Chino, en Californie, et un Horten IV est visible au Deutsches Museum de Munich.