En plongeant son regard dans le Warp, Magnus vit avant tout le monde la trahison d'Horus. Il vit la loyauté de 7 autres primarques changer de camp sous l'influence du Chaos et d'Horus. Pour lui c'était le moment de gloire, la preuve que ses recherches étaient bonnes et utiles. Pour le prouver, il n'envoya pas de vaisseau vers l'Empereur mais un message psychique surpuissant. L'Empereur n'écouta pas le primarque et l'accusa de trahison pour avoir continué les recherches sans autorisation. Il envoya les Space Wolves attaquer Prospero. A l'origine, Leman Russ devait ramener Magnus sur Terra pour qu'il réponde de ses agissements. Mais ayant été mis au courant par Fulgrim de la disgrâce de Magnus et la sanction prise contre lui, Horus, conscient que le primarque des Thousand Sons était assez puissant et informé pour lui mettre des bâtons dans les roues, intervint et manipula discrètement Leman Russ en lui faisant croire que sa cible avait dépassé toute rédemption et qu'il fallait purement et simplement l'éliminer. La bataille entre les fils de Russ et les Thousand Sons fut terrible et à l'avantage des attaquants. Au moment où Leman Russ allait tuer Magnus, ce dernier plongea son esprit dans le Warp pour y trouver assistance et jura allégeance à celui qui lui répondit, en l'occurrence Tzeentch. Il hésita encore jusqu'au dernier moment mais ne voulut pas la perte du savoir accumulé. Au moment où il changea de camp, toute sa légion et lui de même ainsi que sa cité et ses bibliothèques disparurent pour être téléportés sur la planète des sorciers dans l'Œil de la Terreur. Les Thousand Sons participèrent à l'assaut sur Terra lors de l'Hérésie d'Horus.