La Maison de la Mytiliculture a été ouverte pour la première fois au public en 1987, à l'écart du bourg d'Esnandes, dans le complexe touristique de la commune comprenant la piscine, le terrain de camping et autres structures de loisirs, sur la route qui mène au site pittoresque des falaises de la pointe Saint-Clément.
Depuis 2004, ce musée devenu municipal a été transféré dans des locaux plus spacieux au cœur du bourg face à la belle église du village qui est un des rares témoins d'églises fortifiées de l'Aunis.
Ce déménagement a permis de reconstituer entièrement toute la muséographie et de rendre ce musée plus attractif aux visiteurs.
Classé par la suite musée de France, la Maison de la Mytiliculture est également accessible aux personnes handicapées (personnes à mobilité réduite, déficients visuels), renforçant ainsi son attractivité.
Ce musée a acquis au fil du temps une certaine notoriété régionale, figurant à la fois dans de nombreux guides et brochures touristiques comme le Guide Vert Michelin ou dans le site de l'Office du Tourisme de la Charente-Maritime.
Depuis sa profonde restructuration et son transfert dans de nouveaux locaux, il reçoit en moyenne 5 000 visiteurs par an.