A la fin des années 1990, la situation économique oblige swissinfo/SRI à réorienter sa stratégie. La marche triomphale de l'Internet tombe à point nommé, marquant l'avènement d'une ère nouvelle pour les journalistes producteurs et le public.
1999 voit l'ouverture du site www.swissinfo.ch et la mise en ligne des pages en allemand, français, anglais et portugais. Après les sites japonais, italien et espagnol, activés au cours de l'année 2000, le lancement du site arabophone a lieu le 1er février 2001 et la version chinoise apparaît en septembre de la même année. En l'espace de deux ans, la plateforme Internet est mieux connue des Suisses de l'étranger que les programmes radio en ondes courtes.
Le 21 mars 2005, le Conseil d’administration de SRG SSR idée suisse lance un plan de mesures visant à réduire massivement les activités de swissinfo/SRI. La décision de SRG SSR de réduire swissinfo à sa plus simple expression a provoqué des réactions très fortes au sein du public et a rencontré beaucoup d’incompréhension.
Selon le nouveau concept de SRG SSR, le site Internet n'aurait plus proposé que du contenu en langue anglaise, qui aurait été confié à SR DRS, tandis que le contenu rédactionnel dans les langues nationales se serait cantonné à des informations spécifiques pour les Suisses de l’étranger, réalisé dans une seule unité d’entreprise de SRG SSR, à raison d’un journaliste par langue. Cette situation a cependant pu être évitée. L’été 2007, swissinfo reçoit de la Confédération un nouveau mandat de prestations qui prévoit une offre éditoriale clairement axée sur Internet.
Depuis le 1er janvier 2009, Peter Schibli est directeur de swissinfo.ch. Le directeur a pour tâche d’exécuter le mandat de prestations prévu par le Conseil fédéral et de positionner swissinfo.ch comme plate-forme d’informations leader en neuf langues, tant pour les Suisses de l’étranger que pour le public international intéressé par notre pays.