De 1989 à 2000
Au début des années 1980, l'université consiste en un amalgame de campus hétérogène, enseignant principalement l'agronomie pour la population essentiellement rurale de la région. En 1989, tous les établissements d'enseignement supérieur de la région se réunissent sous un même nom et statut, celui de l'UWS. Ils conservent néanmoins leur spécificité, et on retrouve ainsi trois établissements, dont le nom est précédé du sigle UWS : UWS Nepean, UWS Hawkesbury et UWS Macarthur. L'UWS est donc à ce moment-là plus une superstructure qu'une véritable université. Ce n'est qu'en 2000 qu'elle devient une seule université, mais aux campus multiples.
De 2000 à aujourd'hui
En 2000, après une restructuration afin de réduire les coûts de l'université, certaines formations, qui attiraient peu ou pas d'étudiants (ainsi la psychologie critique ou encore les systèmes d'agriculture) sont supprimées. Les étudiants qui, à cette date, avaient débuté des études dans ces domaines pouvaient les terminer, mais les filières n'étaient plus ouvertes au recrutement. La fermeture d'une filière artistique suscita de nombreuses protestations, de nombreux artistes de la région ayant étudié à l'UWS. Ces protestations conduisirent au retrait de la mesure et à la réouverture de la filière.
Au début des années 2000, l'université consolide ses facultés de beaux-arts, de sciences sociales et de psychologie. Des cycles undergraduate en nanotechnologies et biotechnologies sont également créés.
Les équipements informatiques ne sont installés que tardivement, en 2002. En 2003, dans le cadre du Festival de Sydney (la plus grande manifestation culturelle d'Australie), l'UWS accueille une série de conférences sur Samuel Beckett.
Toujours en 2003 une très vive et importante controverse oppose le gouvernement de Nouvelle-Galles du Sud et le gouvernement fédéral d'Australie autour de l'UWS. Dans une lettre au Parlement d'Australie, Jackie Kelly, membre de la chambre des représentants et du Parti libéral d'Australie, accuse le conseil d'administration de l'UWS de mauvaise gestion. Le libéral Charlie Lynn fait écho à cette protestation :
« Au cours de cinq dernières années, la vice-chancellière Janice Reid a changé l'UWS d'une fière université locale, entreprenante, en une université qui aujourd'hui n'est plus capable d'assurer à ses étudiants des cours corrects. Elle a passé plus de temps à s'assurer que les membres du conseil d'administration et que l'université elle-même soient bien du côté du Parti travailliste australien qu'à en faire une institution éducative de premier plan. Il suffit pour s'en rendre compte d'étudier les engagements des membres du conseil d'administration. (...) La composition politique de celui-ci reflète très mal la composition politique de la région de l'ouest de Sydney. »
Au cours d'une session du parlement de Nouvelle-Galles du Sud, l'honorable Diane Beamer, membre du parti travailliste, répond à cette attaque de manière elle aussi très vive. Cette affaire est depuis connue en Australie, et plus particulièrement en Nouvelle-Galles du Sud, comme une illustration du problème de l'indépendance politique des universités.
L'UWS a depuis cette date continué à se développer et à se diversifier, créant notamment en 2007 des bachelors en médecine et chirurgie.