Un appareil de détection ultra rapide de la grippe A H1N1

Une équipe de scientifiques menée par le professeur Toshihisa ISHIKAWA du RIKEN Omics Science Center de Yokohama au Japon vient récemment de développer une technique ultra rapide de diagnostic capable notamment de détecter le nouveau virus grippal A (H1N1) en moins de 40 minutes, soit 100 fois plus rapidement que les examens classiques.

Apparu en avril 2009 au Mexique et aux Etats-Unis, le virus de la grippe A (H1N1) résulte d'un réassortiment d'éléments génétiques de plusieurs virus connus d'origines porcine, humaine et aviaire. Il possède à la surface de son enveloppe deux types de protéine nommés hémagglutinine 1 (H1) et neuraminidase 1 (N1) permettant notamment la fixation et la libération du virus au sein de la cellule cible. Provoquant des symptômes similaires à ceux de la grippe saisonnière, le virus peut cependant donner lieu à des complications sévères entraînant, selon la gravité des cas, l'utilisation d'un traitement antiviral.

La technologie RT-SmartAmp développée par les chercheurs du RIKEN Omics Science Center, dérive de la très récente technique Reverse Transcription Loop-Mediated Isothermal Amplication (RT-LAMP) permettant d'obtenir notamment l'amplification rapide d'un échantillon de matériel génétique grâce à l'utilisation de six amorces et à l'application d'une température constante (60-65°C). La RT-SmartAmp est une méthode associant l'amplification génétique à température constante et la technique SmartAmp classiquement employée pour détecter les polymorphismes nucléotidiques. L'application de ces deux technologies confère à la RT-SmartAmp une grande rapidité et une grande précision. L'emploi d'une amorce fluorescente spécifique d'un sous-type de virus, dans cette étude A (H1N1), limite les risques de fausse réaction avec d'autres types et sous types viraux (A (H3N2), A (H5N1), B...).

Afin de valider l'efficacité de la RT-SmartAmp, les scientifiques ont effectué une étude comparative des méthodes de diagnostic en étudiant des prélèvements rhino-pharyngés de patients souffrant de symptômes grippaux entre le mois d'octobre 2009 et le mois de janvier 2010. Parmi les 255 échantillons cliniques, la grippe A(H1N1) a été détectée chez 140 patients (54,9% des cas) grâce à la RT-SmartAmp. Dans 72,8% des cas, la technique RT-SmartAmp a permis la détection du virus pandémique 24 heures avant l'apparition de fièvre.

La méthode classique RRT-PCR n'a permis de détecter que 110 cas avérés (43,1%), démontrant ainsi les plus grandes précisions, spécificité et rapidité de la technique RT-SmartAmp. Le protocole opératoire complet de cette technique de diagnostic, déjà considérée par certains scientifiques comme la nouvelle référence, a été publié dans la revue scientifique PloSONE datée du 25 janvier 2012.