L'Avachinsky est né vers le milieu ou la fin du Pléistocène. Il y a trente ou quarante mille ans, la caldeira en forme de fer à cheval ouverte vers le sud-ouest s'est formée au cours d'une éruption qui a enseveli une zone de 500 km sous les débris, y compris l'emplacement actuel de la ville de Petropavlovsk-Kamtchatski. À l'intérieur de cette caldeira s'est reconstitué le stratovolcan actuel au cours de deux phases, la première débutée il y a 18 000 ans et la seconde débutée il y a 7 000 ans.
La majorité des éruptions de l'Avachinsky sont d'un indice d'explosivité volcanique compris entre 1 et 3 mais certaines atteignent le niveau 4 comme celles du 25 février 1945, du 26 mars 1926 au 14 mars 1927 ou encore du 27 au 29 juin 1927 pour ne citer que les plus récentes. Certaines éruptions ont même atteint le niveau 5 comme celles de 1500 av. J.-C., 3200 av. J.-C., 4340 av. J.-C. ou bien 5980 av. J.-C.
Le dôme de lave actuel, dont le volume est estimé à dix millions de kilomètres cubes, s'est mis en place au sommet du volcan au cours de l'éruption du 13 au 30 janvier 1991.
Aucune éruption n'a entraîné de lourds dégâts matériels ou des victimes humaines mais la proximité des volcans Avachinsky et Koryaksky avec la ville de Petropavlovsk-Kamtchatski, plus grande ville et capitale du krai du Kamtchatka, et la nature de leurs éruptions explosives ont décidé les volcanologues à les inclure tous les deux dans la liste des volcans de la Décennie.