Banksia aquilonia a le port d'un grand arbuste ou d'un petit arbre pouvant atteindre huit mètres de haut. L'écorce grise est dure et fissurée et les feuilles, elliptiques, ont les bords non dentés.
Les fleurs sont rassemblées en « épis floraux » caractéristiques des Banksia. Ces inflorescences sont constituées de centaines de paires de fleurs serrées de manière dense en spirale autour du rachis ligneux. L'épi floral de Banksia aquilonia, long de 6 à 10 centimètres, est de couleur jaune clair et à peu près cylindrique. Il fleurit de mars à juin.
Bien que les inflorescences soient semblables à celles de Banksia integrifolia, les feuilles sont marquées dans leur différences - la nervure médiane sur la face inférieure des feuilles est nettement couverte de courts poils brun-rougeâtre et les feuilles sont disposées en spirales plutôt qu'en verticilles comme c'est le cas pour toutes les sous-espèces de Banksia integrifolia. Ce sont ces différences que George ressentit comme suffisamment particulières pour considérer Banksia integrifolia comme une espèce séparée.