Chymotrypsine

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Introduction

Chymotrypsine
Chymotrypsin 4cha.png
Caractéristiques générales
Autres noms ou symbolechymotrypsines A et B ; α-chymar ophth ; avazyme ; chymar ; chymotest ; enzeon ; quimar ; quimotrase ; α-chymar ; α-chymotrypsine A ; α-chymotrypsine
Fonctionsérine-protéase
Localisationpancréas
SymboleCTR
Homo sapiens
Chromosome et locus16q23.1
Autre symboleCTRB1
CAS number9004-07-3
Entrez1504
HUGO2521
OMIM118890
RefSeqNM_001906
UniProtP17538
Nomenclature EC3.4.21.1
Homo sapiens
Chromosome et locus16q22.3
Autre symboleCTRB2
Entrez440387
HUGO2522
RefSeqNM_001025200
UniProtQ6GPI1
Homo sapiens
Chromosome et locus1p36.21
Autre symboleCTRC
Entrez11330
HUGO2523
OMIM601405
RefSeqNM_007272
UniProtQ99895

La chymotrypsine (EC 3.4.21.1) est une protéase digestive, fabriquée par le pancréas, de la famille des sérine-protéases, qui peut accomplir la protéolyse. Elle coupe préférentiellement les protéines au niveau de la liaison carboxylique de la tyrosine, du tryptophane, de la phénylalanine ou de la leucine. Ces acides aminés non-polaires crèent une "poche hydrophobe" nécessaire à l'activité enzymatique.

Synthèse et activation

La chymotrypsine est produite par le pancréas sous une forme inactive : le chymotrypsinogène. L'activation est provoquée par la trypsine qui coupe cette molécule en deux chaînes, puis par la chymotrypsine elle-même lors d'une trans-protéolyse, donnant à la fin une structure globualire compacte de trois chaînes reliées par deux ponts disulfures et repliées en 2 domaines de 120 acides aminés.

Ces domaines adoptent la conformation d'un tonneau β formé de 6 brins β.

Le site actif est situé dans une crevasse bordée par les 2 domaines. Il fixe le substrat au niveau de 2 régions (la région 214-216 et la région 189-216 et 226).

Mécanisme d'action

La chymotrypsine intervient dans la protéolyse des protéines du système digestif des mammifères et autres êtres vivants. Elle catalyse le clivage des chaînes polypeptidiques par hydrolyse, mécanisme au départ extrêmement lent sans un activateur.

La chymotrypsine attaque les groupes carbonyles potentiellement nucléophiles impliqués dans une liaison peptidique grâce à la sérine 195, laquelle se lie à son substrat pour former un intermédiaire substrat-enzyme covalent. Le site actif de l'enzyme fait également intervenir les acides aminés His57, Asp102 et Gly193.

Il a été montré que la réaction de la chymotrypsine avec son substrat se produit en deux phases : une phase initiale d'éclatement au tout début de la réaction, puis une phase d'état stationnaire qui suit la loi de Michaelis-Menten.

La chymotrypsine doit absolument être conservée au froid pour garder l'activité enzymatique.

Séquence

Séquence du chymotrypsinogène B1 (gènes 16q23 et 16q24.1)

10 20 30 40 50 60 MASLWLLSCF SLVGAAFGCG VPAIHPVLSG LSRIVNGEDA VPGSWPWQVS LQDKTGFHFC 70 80 90 100 110 120 GGSLISEDWV VTAAHCGVRT SDVVVAGEFD QGSDEENIQV LKIAKVFKNP KFSILTVNND 130 140 150 160 170 180 ITLLKLATPA RFSQTVSAVC LPSADDDFPA GTLCATTGWG KTKYNANKTP DKLQQAALPL 190 200 210 220 230 240 LSNAECKKSW GRRITDVMIC AGASGVSSCM GDSGGPLVCQ KDGAWTLVGI VSWGSDTCST 250 260 SSPGVYARVT KLIPWVQKIL AAN

Séquence du chymotrypsinogène B2 (gène 16q23.1)

10 20 30 40 50 60 MAFLWLLSCW ALLGTTFGCG VPAIHPVLSG LSRIVNGEDA VPGSWPWQVS LQDKTGFHFC 70 80 90 100 110 120 GGSLISEDWV VTAAHCGVRT SDVVVAGEFD QGSDEENIQV LKIAKVFKNP KFSILTVNND 130 140 150 160 170 180 ITLLKLATPA RFSQTVSAVC LPSADDDFPA GTLCATTGWG KTKYNANKTP DKLQQAALPL 190 200 210 220 230 240 LSNAECKKSW GRRITDVMIC AGASGVSSCM GDSGGPLVCQ KDGAWTLVGI VSWGSRTCST 250 260 TTPAVYARVA KLIPWVQKIL AAN