Située sur la commune de Fontaine-de-Vaucluse près d'Avignon, dans le département de Vaucluse. Vaucluse était autrefois le nom du village et a donné son nom au département. Cette homonymie engendrant de nombreux problèmes, la commune fut rebaptisée Fontaine-de-Vaucluse. Son nom médiéval Vallis Clausa (« vallée close » en latin), en raison de sa position topographique, est à l'origine du toponyme Vaucluse.
Géologie
Au-dessus de la fontaine se trouve une falaise de calcaire de 500 à 800 mètres d'épaisseur, parcourue par d'innombrables cassures et failles. Celle-ci joue le rôle d'un réservoir, un aquifère karstique, l'eau y circulant en suivant les discontinuités jusqu'à rencontrer une barrière de calcaire et d'argile.
La source est l'unique point de sortie d'un bassin souterrain de 1 100 km² récupérant les eaux du mont Ventoux, des monts de Vaucluse, du plateau d'Albion et de la montagne de Lure. Elle alimente la Sorgue.
L'eau de cette résurgence contenant un taux moyen de 200 mg/litre de carbonate de calcium et ayant un débit annuel d'environ 700 millions de m³, ce réservoir d'alimentation perd chaque année 50 000 m³ de calcaire. Ce phénomène de karstfication rapporté à la surface de l'impluvium représente un volume annuel de 45 m³/km² qui disparait dissous dans l'eau.
Ce chiffre devient plus parlant quand les calculs démontrent que dans 3,5 millions d'années, en toute logique, les monts de Vaucluse, le plateau d'Albion et la montagne de Lure, d'une épaisseur de 1 500 m, devraient avoir totalement disparu.