Taxinomie
L'espèce a été décrite par Spencer Fullerton Baird en 1858, sous le protonyme Hesperomys emericus. Elle fait partie, avec Peromyscus californicus du sous-genre Haplomylomys.
Sous-espèces
- Peromyscus eremicus eremicus (Baird, 1858), la sous-espèce type, vit plus au nord en l'Utah ;
- Peromyscus eremicus anthonyi (Merriam, 1887), a la fourrure plus foncée que la sous-espèce type.