Les archéobactéries thermophiles (anciennement appelées thermoacidophiles) sont des archéobactéries qui s'accommodent de la chaleur. On parle de thermophiles, voire d'hyperthermophiles, lorsqu'elles se développent à plus de 80 °C). Ces organismes sont chimiotrophes.
Par exemple :
- les sulfolabales
- les thermoprotéales
- les thermococcales