La base abrite aujourd'hui un escadron de chasse des Forces aériennes stratégiques volant sur Mirage 2000N et équipé de missiles nucléaires ASMP : l'Escadron de Chasse 2/4 La Fayette.
L'Escadron de Chasse 1/4 Dauphiné a été dissous le 29 juin 2010.
Le Centre d'instruction tactique 339 Aquitaine n'est plus présent sur la BA 116, depuis 2001. Seul un simulateur de vol subsiste sur la base.
La base aérienne est protégée par l'Escadron de Défense Sol-Air 4/950 Servance équipé notamment de missiles Crotale (missile).