Base azotée

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Introduction

Base azotéeNucléoside
Chemical structure of adenine

Adénine
Chemical structure of adenosine

Adénosine

A
Chemical structure of guanine

Guanine
Chemical structure of guanosine

Guanosine

G
Chemical structure of thymine

Thymine
Chemical structure of thymidine

Thymidine

T
Chemical structure of uracil

Uracile
Chemical structure of uridine

Uridine

U
Chemical structure of cytosine

Cytosine
Chemical structure of cytidine

Cytidine

C

Les bases azotées (aussi appelées bases nucléiques ou nucléobases) sont des molécules qui font partie des nucléotides, qui sont eux-mêmes des éléments de l'ARN et de l'ADN.

C'est par les liens hydrogène entre paire de bases azotées que sont liés deux brins de l'hélice d'ADN.

Il existe cinq principales bases azotées présentes dans l'ADN et l'ARN : adénine, cytosine, guanine, thymine et uracile. L'adénine, la thymine, la cytosine et la guanine sont présentes sur les nucléotides de l'ADN, l'uracile remplace la thymine sur les nucléotides de l'ARN. Leurs abréviations respectives sont A, C, G, T et U. Généralement on identifie le nom de la nucléobase au nom du nucléotide correspondant.

La séquence de base d'un acide nucléique permet de déterminer dans le cas d'un gène la séquence d'acides aminés du polypeptide concerné. On peut trouver néanmoins d'autres bases comme la dihydrouridine (DHU), l'inosine ou encore la xanthine ou le pseudo-uracile qui découlent de modifications effectuées sur les bases présentées précédemment.

On distingue les bases puriques et les bases pyrimidiques.

Les bases puriques

  • L'adénine : 6-aminopurine (ou 1,6-dihydro-6-iminopurine)
  • La guanine : 2-amino-6-oxopurine

Les bases pyrimidiques

  • La cytosine : 4-amino-2-oxopyrimidine
  • La thymine : 5-méthyl-2,4-dioxopyrimidine
  • L'uracile : 2,4-dioxopyrimidine

Ces bases contiennent un seul cycle et sont numérotées dans le sens horaire.

Le code à une Lettre

Les séquences nucléotidiques sont représentées comme une succession de bases azotées, symbolisées par une lettre, de 5' vers 3'. Exemple: atgc signifie que nous avons à partir de l'extrémité 5' , des nucléotides, portant successivement une adénine, une thymine, une guanine et une cytosine.

Base ou type de basescode à une lettre
AdénineA
ThymineT
GuanineG
CytosineC
InosineI
UracileU
Purine : Adénine ou GuanineR
Faible liaison (deux liaisons hydrogène) : Adénine ou ThymineW
Fonction cétone dans le grand sillon de l'ADN : Thymine ou GuanineK
Pas une AdénineB
Pas une ThymineV
Pyrimidine: Thymine ou CytosineY
Forte liaison (trois liaisons hydrogène) : Cytosine ou GuanineS
Fonction amine dans le grand sillon de l'ADN : Adénine ou CytosineM
Pas une CytosineD
Pas une GuanineH
QuelconqueN