La section septentrionnale
L'Égypte disposait d'un réseau ferroviaire depuis 1856, reliant Alexandrie au Caire, et qui descendait vers le sud jusqu'à Assouan. L'écartement des voies en Égypte était de 1,435 mètres. Après une traversée en ferry sur le Nil, le chemin de fer continuait au Soudan, de Wadi Halfa jusqu'à Khartoum, avec un écartement de 1,067 mètres. Cette partie du réseau fut commencée par Lord Kitchener en 1897 quand il eut maté la révolte mahdiste. D'autres lignes s'éloignaient vers le sud, le point le plus méridionnal étant Wau. Cependant, une grande partie du réseau soudanais est actuellement inexploité suite aux différentes guerres civiles et autres troubles politiques.
Le chemin de fer ougandais
L'Afrique orientale a un réseau de chemin de fer à écartement étroit (1,00m), développé au départ de l'océan Indien, et développé vers l'ouest en parrallèle sous la colonisation allemande (Tanzanie) et britannique (Kenya). Son extension nord est l'Uganda Railway. Ces deux réseaux furent reliés et il existe une connexion entre Kampala, Ouganda, le lac Victoria d'une part, et les côtes océaniques à Mombasa au Kenya et Dar es Salaam en Tanzanie d'autre part. Plusieurs compagnies nationales exploitent ces lignes, l'Uganda Railway Corporation, la Kenya Railway Corporation, et la Tanzania Railway Corporation.
La liaison de la TAZARA
Une ligne de chemin de fer séparée de 1 860 km relie Kapiri Mposhi en Zambie fut terminée au bout de six ans par des travailleurs de la République populaire de Chine en 1976. Le chemin de fer Tanzanie-Zambie (Tanzania-Zambia-Railroad ou TAZARA) fut construit pour désenclaver la Zambie et ses ressources minérales au port de l'Océan Indien, indépendamment du réseau de l'Afrique du Sud et des territoires à cette époque contrôlés par les Portugais. Non prévue dans le projet initial Le Cap-Le Caire, la ligne de la TAZARA établit une liaison importante. Cette partie a le même écartement de 1,067m que celui en Afrique australe.
La section méridionnale
La section méridionnale fut terminée au cours de la domination britannique avant la Première Guerre mondiale. Elle fut interconnectée avec le système à écartement 1,067m du Cap. La construction commença au Cap et montait en parrallèle avec la Great North Road jusqu'à Kimberley, passant ensuite à travers le Botswana jusqu'à Bulawayo. La ligne continuait ensuite vers le nord, section actuellement exploitée par la National Railways of Zimbabwe, jusqu'à la traversée du Zambèze. Le pont des chutes Victoria fut terminé en 1905. Le réseau est ensuite exploité par Zambia Railways et continue par Lusaka et Kapiri Mposhi, où il rejoint la ligne de la TAZARA vers la Tanzanie.