SfXun organise chaque année un Gospel, spectacle à vocation religieuse rassemblant des professeurs et des élèves de toutes les classes. De même, les élèves des trois classes du cycle supérieur ont une retraite de 3 jours au début du second semestre. Le Centre Scolaire organise encore des activités d'importance comme le Projet Vélo (pour les troisièmes), le voyage à Londres (pour les quatrièmes), le voyage en France (pour les deuxièmes), les rencontres élèves-correspondants étrangers et la Saint-Nicolas dont la conception et la responsabilité reviennent aux rhétoriciens. En outre, chaque classe de rhéto (bien aidée par son titulaire) organise annuellement un voyage culturel à l'étranger. Pour les professeurs, l'Amicale SFX (voir le site référencé à l'onglet Anciens sur le site officiel du collège Saint-François-Xavier, voir liens externes ci-dessous), est une organisation très vivante et gratuite. Elle veille à développer la convivialité au sein de l'équipe professorale. Depuis quelques années, l'Amicale se charge d'organiser avec originalité les festivités déployées lors de la mise à la retraite des enseignants concernés, chaque fois surpris par la date et l'ampleur de cette célébration.