Les copépodes sont de petites tailles.
Ils n'ont ni branchies ni carapace, et ne présentent qu'un seul œil, médian, dit « oeil nauplien ».
Ils nagent par petits sauts, à l'aide d'antennes natatoires.
Les femelles sont reconnaissables à leurs deux sacs ovigènes latéraux.
Certaines espèces de copépodes sont parasites de cnidaires, mollusques, crustacés, ascidies, poissons (pou du poisson), cétacés. La morphologie des espèces parasites est très différente de celle des espèces de copépodes libres.
Là où ils sont nombreux, ils peuvent constituer jusqu'à 60% de la biomasse du zooplancton océanique .
Aspects morphologiques
- Dimorphisme sexuel : la femelle est reconnaissable aux sacs ovigènes. L'asymétrie de la 5 paire de pattes chez de nombreuses espèces caractérise le mâle. Elle est parfois terminée par un crochet ou une pince chez les espèces qui l'utilisent pour s'accrocher à la femelle ou déposer leur spermatophore. L'abdomen également dit urosome est composé de 5 anneaux cylindriques chez le mâle ; mais seulement 4 chez la femelle (fusion des deux premiers segments) ; ce premier segment porte ventralement l'orifice génital.
Avec quelques exceptions pour les espèces parasites, leurs caractéristiques sont les suivantes :
- corps en deux parties (région antérieure ovoïde regroupant le céphalosome et le thorax, région postérieure, courte et cylindrique, correspondant à l'abdomen terminée par un organe en forme de furca ;
- Céphalosome constitué par la fusion des 5 segments céphaliques avec le 1er (et parfois le 2ème) segment thoracique, (c'est l'origine des maxillipèdes associés aux pièces buccales).
- oeil unique nauplien (qui a fait qu'on les a autrefois appelés « monocles » ;
- Antennules (A1) ; ces fausses antennes sont longues et dures. Elles portent de nombreuses soies sensorielles et semblent servir de balanciers lors de la nage ;
chez certaines espèces, le mâle possède une ou deux antennules géniculées qui l'aident à s'accoupler ;
- Antennes (A2) plus courtes et biramées ;
- pièces buccales constituées de mandibules biramées avec à leur base une expansion chitineuse denticulée et durcie sur leur couronne par de la silice. Chez certaines espèces les maxilles et maxillipèdes sont ornés de grandes soies filtrantes, collectant le nanoplancton et le rapportant à la bouche ;
- Thorax en 5 segments libres, chacun garni d'une paire de pattes natatoires biramées garnies de soies. La copula est une petite piéce chitineuse transversale soudant les deux appendices de chaque paire de pattes, permettant un battement natatoire synchrone ;
- Abdomen composé de 4 ou 5 segments avec sur l'élément terminal l'anus (dorsal) au dessus de deux rames caudales articulées et garnies de soies (furca). Chez la plupart des espèces, l'abdomen ne porte plus aucun appendice (chez les "Gymnopléens" ; Calanides). Mais les "Podopléens" (Cyclopides ou Harpacticides) ont conservé des pattes sur le 5ème segment thoracique .
Sauf les crabes, ils ont une carapace, deux yeux, mais ils n'ont pas de branchies