En biologie, le cortex (mot latin signifiant écorce) désigne la couche superficielle ou périphérique d'un tissu organique.
Par métonymie, le terme sert souvent à désigner le cortex cérébral, ainsi on parlera du cortex pariétal pour désigner la couche de neurones du cerveau formant le cortex du lobe pariétal.
Exemples d'organes présentant un cortex identifié :
- cerveau : cortex cérébral
- cervelet : cortex cérébelleux
- rein : cortex rénal
- glande surrénale : cortex surrénal
- ovaire : cortex ovarien
- thymus : cortex thymique