L'école des apprentis mécaniciens de l'armée de l'air est créée en 1932 à Rochefort. Elle regroupe les formations de toutes les spécialités techniques des sous-officiers de l'armée de l'air.
L'école est située sur le terrain de l'aéronavale de Soubise, à l'ouest du centre-ville de Rochefort.
Dès le début des années 1960, l’évolution des effectifs et des techniques donnait à l’école un certain aspect vieillissant et désordonné.
Alors qu’en 1969, le ministère de la défense annonce le départ de l’école à Évreux, les réactions sont unanimes dans le département et Albert Bignon, député du département de la Charente-Maritime, réussit in extremis à faire annuler la décision. L’école restera donc en Charente-Maritime, mais il faut trouver alors une nouvelle localisation et rapidement.
Sans encore avoir choisi le site, l’armée de l’Air exigeait que soit construite une piste de 1700 x 30 mètres sur le même site. En effet, sur le site de l’aéronavale, une seule piste en herbe utilisable de mai à octobre existait.
Après quelques études rapides, le choix du nouveau site se portait sur l’espace actuel où se situe l’aéroport sur les communes de Saint-Agnant, Échillais et Soubise.
En 1979, l'école des apprentis mécaniciens de l'armée de l'air se situe dorénavant au sud de Rochefort. Elle étend son champ d'activité en accueillant successivement le centre pédagogique en 1984, l'école de gestion et d'administration en 1993 et en 1996, l'école de formation initiale des sous-officiers.
En septembre 1998, elle prend le nom d'école de formation des sous-officiers de l'armée de l'air. L'EFSOAA devient ainsi le pôle de formation des sous-officiers de l'armée de l'air. Elle est commandée par un officier général, commandant de la place d'armes de Rochefort.
Depuis 2002, elle accueille aussi la formation des mécaniciens de l'aéronautique navale, jusqu'alors dispensée au centre de l'aéronautique navale de Rochefort dissous en juin de la même année.
