L'école propose des masters recherche en cohabilitation avec d'autres institutions académiques :
- "Économie du développement durable, de l'environnement et de l'énergie (EDDEE)" (voie Recherche) ou "Economie et Politique de l'Energie et de l'Environnement (EPEE)" (voie Professionnelle) en partenariat avec des écoles de ParisTech (Polytechnique, Mines ParisTech, Ponts ParisTech, AgroParisTech, ENSTA ParisTech, écoles pour lesquelles les étudiants peuvent effectuer leur dernière année d'école dans cette formation), l'EHESS, l'INSTN-CEA et l'Université Paris-X Nanterre. Au sein du centre Économie et Gestion de l'ENSPM, ce Master 2 en économie forme des analystes du secteur énergétique (option Économie, Finance et Marchés de l'Énergie) et des ingénieurs économistes spécialisés dans les projets bas carbone (option Gestion de Projets).
Si jusqu'à présent seuls les élèves des écoles ParisTech effectuant leur dernière année d'école d'ingénieur au sein du Master pouvaient bénéficier de l'apprentissage (par le CFA de leur établissement d'origine, cas de l'AgroParisTech, par exemple), la rentrée 2010 offrira aux élèves qui le souhaitent la possibilité d'effectuer ce parcours par l'apprentissage, sous réserve de trouver une entreprise d'accueil.
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"Lithosphère, bassin, pétrole" en partenariat avec l'Université Pierre-et-Marie-Curie (Paris-VI Jussieu).
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"Catalyse et Procédés" en partenariat avec l'École centrale de Lille et l'École nationale supérieure de chimie de Lille.
Le collège doctoral IFP/IFP School permet aux étudiants de réaliser un thèse de doctorat à l'IFP. Les thèmes de recherche sont variés et concernent tous les maillons de la chaîne énergétique.
IFP School propose également des programmes d'une durée d'un an maximum réservés à des professionnels en activité dans l'industrie et titulaires d'un diplôme de niveau bac+4 minimum. Ces programmes consistent en 4 mois de cours minimum suivis d'un stage industriel d'au moins 4 mois. Ils conduisent à la délivrance du "Graduate Diploma of Petroleum Studies" (diplôme d'établissement) ou du "Mastère spécialisé" (label de la Conférence des Grandes Écoles – CGE).
Dans ce cadre les formations proposées sont les suivantes:
- Graduate Diploma, major in Petroleum Geosciences (organisé à Pau dans le Sud-Ouest de la France)
- Graduate Diploma, major in Petroleum Engineering (organisé à Pau dans le Sud-Ouest de la France)
- Mastère spécialisé en Moteurs
- Mastère spécialisé en Energy Management (programme exécutif organisé avec la BI Norwegian School of Management-Oslo et ESCP Europe - Paris)