L'apport de Jean Valnet est sans conteste la diffusion des connaissances et de l'enseignement de la phytothérapie et l'aromathérapie (voir Œuvres).
Dès 1948, il expose le résultat de ses travaux sur la phytothérapie et l’aromathérapie dans de nombreuses publications médicales et divers ouvrages devenus célèbres (voir Œuvres).
Dès 1960, il préside des Congrès avec pour assesseurs des professeurs de Faculté et membres de l'Académie de Médecine ; il fait de nombreuses conférences en France et à l'étranger (Angleterre, Belgique, Canada, Espagne, Etats-Unis, Gabon, Iran, Liban,...), etc.
Depuis 1961, il est membre correspondant du « Centre International de Recherche Biologique » à Genève.
Depuis cette époque, de nombreuses revues scientifiques et la grande presse française ou étrangère consacrent régulièrement des articles, rubriques et comptes-rendus à ses activités.
En 1971, il fonde l'Association d'études et de recherches en aromathérapie et phytothérapie (A.E.R.A.P. - loi de 1901), première Société du genre en France, qu'il transforme en 1973 en Société française de phytothérapie et d’aromathérapie (S.F.P.A. - loi de 1901). Il l’abandonne en 1980, suivi par tous les membres de son comité d'honneur (professeurs de Faculté, universitaires, personnalités diverses) en raison d'attitudes équivoques de plusieurs membres de son bureau et de l'atmosphère d'intrigues.
En 1981, il fonde le Collège de phyto-aromathérapie et de médecines de terrain de langue française (J.O.R.F du 2/04/81) (loi de 1901) qui a pour objet, à l'instar de sa première société :
- de regrouper les médecins, pharmaciens, vétérinaires, chirurgiens-dentistes, biologistes, kinésithérapeutes, diététiciens(ennes) et esthéticiens(ennes) qui poursuivent les recherches et études sur la phytothérapie, l'aromathérapie
- d'utiliser tous les moyens et études de recherches scientifiques mis à sa disposition, y compris la mise en oeuvre d'analyses pour dépister les fraudes ou falsifications dans toutes préparations thérapeutiques à usage médical, et d'établir des critères précisant la qualité des produits.
- d'organiser un enseignement post-universitaire destiné aux praticiens.
- de mettre tous les moyens à disposition et plus particulièrement séminaires, documentation dans le cadre de la formation permanente.
Nonobstant ses observations cliniques, il s’intéresse également à l'étude des propriétés anti-infectieuses, antibiotiques des huiles essentielles et à leurs modes d'action à la lumière de la bioélectronique de Louis Claude Vincent .
En 1971, le docteur Maurice Girault (de Dijon) crée le terme d'aromatogramme pour caractériser cet antibiogramme particulier effectué, non plus avec des antibiotiques classiques, mais avec des huiles essentielles. Le Dr Jean Valnet sera un des premiers (en 1964 pour les premières publications à destination du grand public) à diffuser dans le grand public les connaissances sur l'aromathérapie et l'aromatogramme.
Depuis 1976, le docteur Jean Valnet organise un congrès de phytothérapie et d'aromathérapie (à Paris, Monte-Carlo, Lyon) et de nombreuses journées d'informations.
Signalons qu'il participa également à de nombreuses émissions radiophoniques en direct avec les auditeurs ainsi qu'à la télévision (en France et à l'étranger).
Grâce à son travail inlassable de "défense et d'illustration" de la phytothérapie et de l'aromathérapie, il fut un acteur du renouveau d'intérêt du public et de certains médecins pour ces thérapeutiques.