Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Lissamphibia (Lissamphibiens, ou Amphibiens actuels), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa). Les points qui font l'objet de débats au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés avant la bibliographie.
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.
▲ └─o Lissamphibia ou Amphibia s.s. ├─o Gymnophiona │ └─o Apoda └─o ├─o Allocaudata (éteint) └─o Batrachia ├─o Caudata │ └─o Urodela │ ├─o Cryptobranchoidei │ └─o Diadectosalamandroidei └─o Salientia └─o Anura ├─o Leiopelmatidae └─o Lalagobatrachia ├─o Xenoanura ou Pipoidea └─o Sokolanura ├─o Costata └─o Acosmanura ├─o Anomocoela └─o Neobatrachia ├─o Heleophrynidae └─o Phthanobatrachia ├─o Ranoides └─o Hyloides
 Litoria infrafrenata (Hylidae) |  Agalychnis callidryas (Hylidae) |  Dendrobates auratus (Dendrobatidae) |  Dendrobates leucomelas (Dendrobatidae) |
 Phyllobates terribilis (Dendrobatidae), une des espèces les plus venimeuses au monde |  Leptopoelis vermiculatus (Hyperoliidae) |  Pipa pipa (Pipidae) |  Salamandra salamandra (Salamandridae) |
 Triturus alpestris (Salamandridae) |  Proteus anguinus (Proteidae) |  Ichthyophis sp. (Caeciliidae) |
Le cladogramme ci-dessus reproduit la classification de Frost et al. 2006, à propos de laquelle l'invention de nouveaux noms a été contestée.