La planète SR-388, mentionnée dans le premier jeu de la série, Metroid, est la planète d'origine des métroïdes. D'après l'introduction de Metroid, toute forme de vie (à l'exception des métroïdes) a disparue de la planète, et les métroïdes en sont probablement la cause. Dans Metroid II: Return of Samus, des vaisseaux sont envoyés par la Fédération Galactique pour vérifier si la menace métroïde a effectivement été éliminée. Après avoir eu confirmation que des métroïdes étaient toujours présents sur la planète, la Fédération envoie Samus sur SR-388 pour éradiquer les métroïdes. Dans Metroid Fusion, Samus découvre qu'en supprimant les métroïdes de SR-388, elle avait laisser libre cours à la reproduction des X, des parasites qui infectent Samus à son arrivée sur SR-388 pour une mission de recherche. Les X étant la nourriture des métroïdes, une cellule métroïde est injectée dans le corps de Samus, lui permettant de résister l'infection.