A la fondation de la République fédérale d'Allemagne (RFA), en 1949, Konrad Adenauer crée deux ministères ayant compétence en matière de travaux publics et de transports : le ministère fédéral du Logement (Bundesministerium für Wohnungsbau) et le ministère fédéral des Transports (Bundesministerium für Verkher).
En 1961, le portefeuille du Logement est transformé en ministère fédéral du Logement, de l'Urbanisme et de l'Aménagement du territoire (Bundesministerium für Wohnungswesen, Städtebau und Raumordnung), mais la référence à l'aménagement du territoire disparaît dès 1965. L'année 1969 est marquée pour sa part par la fusion du ministère des Transports avec le ministère fédéral des Postes et des Télécommunications (Bundesministerium für Verkher, das Post- und Fernmeldewesen).
Séparés en 1972, l'année où le ministère du Logement prend son titre définitif de ministère fédéral de l'Aménagement du territoire, de la Construction et de l'Urbanisme (Bundesministerium für Raumordnung, Bau und Städtbau), Transports et Postes sont réunis dès 1974 et jusqu'en 1980.
En 1989, Gerda Hasselfeldt devient la première femme titulaire du portefeuille de l'Aménagement du territoire. Neuf ans plus tard, la coalition rouge-verte fusionne les deux ministères dans celui des Transports, de la Construction et du Logement (Bundesministerium für Verkehr, Bau- und Wohnungswesen). Il prend son titre actuel en 2005, sur décision de la grande coalition d'Angela Merkel.
Suite à sa nomination le 28 octobre 2009, Peter Ramsauer devient le premier non social-démocrate à occuper ce portefeuille.