Selon ITIS :
- Orthogeomys cavator (Bangs, 1902)
- Orthogeomys cherriei (J. A. Allen, 1893)
- Orthogeomys cuniculus Elliot, 1905
- Orthogeomys dariensis (Goldman, 1912)
- Orthogeomys grandis (Thomas, 1893) - Gauphre à poche géant
- Orthogeomys heterodus (Peters, 1865)
- Orthogeomys hispidus (LeConte, 1852)
- Orthogeomys lanius (Elliot, 1905)
- Orthogeomys matagalpae (J. A. Allen, 1910)
- Orthogeomys thaeleri Alberico, 1990
- Orthogeomys underwoodi (Osgood, 1931)
Selon NCBI :
- Orthogeomys cavator
- Orthogeomys cherriei
- Orthogeomys grandis
- Orthogeomys heterodus
- Orthogeomys hispidus
- Orthogeomys underwoodi
Selon Mammal Species of the World :
- sous-genre Orthogeomys (Heterogeomys)
- Orthogeomys hispidus
- Orthogeomys lanius
- sous-genre Orthogeomys (Macrogeomys)
- Orthogeomys cavator
- Orthogeomys cherriei
- Orthogeomys dariensis
- Orthogeomys heterodus
- Orthogeomys matagalpae
- Orthogeomys thaeleri
- Orthogeomys underwoodi
- sous-genre Orthogeomys (Orthogeomys)
- Orthogeomys cuniculus
- Orthogeomys grandis