Pendant la guerre, le J-3 sera sélectionné par l'armée américaine comme avion d'entrainement, d'observation, de liaison et d'évacuation de blessés.
Plusieurs milliers seront construits sous la désignation Piper L-4, reconnaissables à leur cabine plus largement vitrée que les versions civiles.
Les L-4 seront surnommés Grasshoppers, c’est-à-dire sauterelles, pour leur tendance à rebondir à l'atterrissage.
Un planeur d'entraînement sera même dérivé du J-3 sous la désignation TG-8.
C'est un Piper Cub (n° 329911) qui, le 24 août 1944 avec le Capitaine Jean Callet aux commandes et le Lieutenant Étienne Mantoux comme observateur, survolera à très basse altitude Paris et la Préfecture de Police pour transmettre aux résistants le message du Général Leclerc « Tenez bon, nous arrivons » annonçant l'arrivée imminente des troupes franco-américaines afin de délivrer la ville de l'occupation allemande. Egalement, l'armée Française l'utilisera pour le guerre d'Algérie(obsevations,météo,déplacement de l'état major,photos etc...)Plus tard l'alat s'en servira pour surveiller le mur de Berlin,avec des vols au petit matin.Cet avion peut voler à basse vitesse,appelé vol au second régime 2050 t/m vitesse 60 nœuds; à cet étape de vol l'avion est très silencieux.L'astuce était dans la mesure du possible de voler vers l'ennemie face au vent; le bruit déjà relativement faible, l'avion devenait presque silencieux le vent de face chassant le bruit vers l'arrière.Cela surprenait bien des gens aux sol.Dans les années 80 ces avions étaient employés à la surveillance des forêts dans le sud de la France pour observer les débuts d'incendies, ils étaient basé sur l'aérodrome de Luc le Cannet. Cette activité a été annulé après l'installation de mirador.