Fondée en 1949, la ville s'appela d'abord Piaty Potchtovy (Пятый Почтoвый), puis Tomsk-7 (Томск-7), de 1954 à 1992.
Seversk est le site du Groupe sibérien des entreprises de chimie créé en 1954. Il comprend plusieurs réacteurs nucléaires et des installations de séparation isotopique, d'enrichissement et de retraitement de l'uranium et du plutonium. Les armes nucléaires étaient produites et stockées sur place.
L'usine russe de Seversk possède la particularité de pouvoir réenrichir l'uranium de retraitement.
La ville a été une ville secrète de l'Union soviétique jusqu'à ce que le président Boris Ieltsine décrète en 1992 que les villes secrètes pouvaient utiliser leurs noms. Auparavant, la ville n'était mentionnée sur aucune carte.
Aujourd'hui, en dépit du décret qui a levé le statut du secret, la ville demeure fermée pour les non-résidents et obligeant ainsi ceux qui souhaitent s'y rendre à obtenir une autorisation spéciale.
