Orientation bibliographique en microbiologie

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Introduction

Cette page n'a ni la prétention ni pour objet de proposer une liste exhaustive des références relatives à la microbiologie, une telle entreprise serait, bien-entendu, sans fin... Son ambition est de présenter une liste d'ouvrages, de publications ou de sites internet reconnus par la communauté scientifique comme incontournables ou majeurs, qu'ils soient généraux ou plus ciblés. Pour les sujets comportant une liste de références trop importante, se reporter aux éventuelles sous-pages plus spécialisées via les liens proposés. Le second objectif de cette page est, pour chaque groupe, d'en présenter les grandes lignes historiques de la littérature ainsi que d'en citer les auteurs ayant le plus de notoriété. Pour des références se rapportant plus spécifiquement à l'évolution, consulter la page Orientation bibliographique sur l'origine et l'évolution du vivant.

Escherichia coli (Proteobacteria, Enterobacteriaceae)

Foraminifères benthiques. Dans le sens des aiguilles d'une montre depuis en-haut à gauche : Ammonia beccarii, Elphidium excavatum clavatum, Buccella frigida, et Eggerella advena (Foraminifera)

Isotricha intestinalis (Ciliata)

Diatomées marines

Plasmodium sp. (Plasmodiidae), agent du paludisme

Microbiologie générale

Bibliographie

  • Prescott, L.M., Harley, J.P., Klein, D.A., 2003. Microbiologie. De Boeck (ed).
  • Madigan M.T. and Martinko J.M., 2001. Brock Biology of Microorganisms. Prentice Hall (ed).
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Sites internet

Microbiologie médicale

Bibliographie

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Références par groupes

Eubacteria

Bibliographie

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Archaea

Bibliographie

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Eukaryotes unicellulaires (en général)

Bibliographie

  • Patterson, D., 1996. Free-Living Freshwater Protozoa : A Colour Guide. ASM Press (ed.).
  • Puytorac (de), P., Grain, J., Mignot, J.P., 2006. Précis de protistologie. Lubrecht & Cramer Ltd (éd.). 581 p. ISBN 2850040495; ISBN 978-2850040498.
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Sites internet

Micro*Scope est la source d'images de protistes la plus riche à l'heure actuelle.

Algues unicellulaires

Algaebase représente aujourd'hui LA référence en matière de taxonomie des microalgues.

Alveolata

Bibliographie

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Ciliata

Bibliographie

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Dinoflagellata

Bibliographie

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Apicomplexa

Bibliographie

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Chromista

Bibliographie

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Oomycota

Bibliographie

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Bacillariophyta

Bibliographie

  • Loir, M., 2004. Guide des diatomées. Delachaux et Niestlé (éd.).
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Cryptophyta

Bibliographie

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Haptophyta

Bibliographie

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Rhizaria

Bibliographie

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Actinopoda - Acantharea

Bibliographie

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Actinopoda - Heliozoa

Bibliographie

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Actinopoda - Radiolaria

Bibliographie

  • Bykhovsky, B.E., 1971. Radiolaria of the World Ocean. Pensoft (ed.), 420 pp. (en russe)
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Foraminifera

Bibliographie

  • Sen Gupta, B.K., 1999, 2002. Modern Foraminifera. Kluwer Academic Publishers (ed.), 371 pp. ISBN 0412824302 (1999); ISBN 1402005989 (2002).
  • Murray, J., 2006. Ecology and Applications of Benthic Foraminifera. Cambridge University Press (ed.), 426 pp. ISBN 0521828392.

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Chlorarachniophyta

Bibliographie

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Excavata

Bibliographie

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Euglenozoa

Bibliographie

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Parabasalia

Bibliographie

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Metamonada

Bibliographie

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Percolozoa

Bibliographie

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Glaucophyta

Bibliographie

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Amoebozoa

Bibliographie

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Rhizopoda

Bibliographie

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Mycetozoa

Bibliographie

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Mycota

Bibliographie

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Microsporidia

Bibliographie

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Choanoflagellata

Bibliographie

  • Leadbeater, B., Thomsen, H., 2000. Order choanoflagellida. In « An Illustrated Guide to the Protozoa », by Leadbeater, B. and Thomsen, H. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), 14-38.
  • Leadbeater, B., Kelly, M., 2001. Evolution of animals choanoflagellates and sponges. Water and Atmosphere Online, 9 (2) : 9-11.
  • Nerad, A., Daggett, P., 1992. Cultivation of Choanoflagellates. In « Protocols In Protozoology », by Nerad, A. and Daggett, P. Society of Protozoologists, Lawrence (ed.), A-20.1-A-20.4.

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Virus

Bibliographie

  • Boyer, M., Yutin, N., Pagnier, I., Barrassi, L., Fournous, G., Espinosa, L., Robert, C., Azza, S., Sun, S., Rossmann, M.G., Suzan-Monti, M., La Scola, B., Koonin, E.V., Raoult, D. : Giant Marseillevirus highlights the role of amoebae as a melting pot in emergence of chimeric microorganisms. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2009 (pdf)
  • Raoult, D., 2006. Mimivirus : le plus gros des virus. Pour la Science, janvier 2006, p54-59.
  • Pierre Ardoin : Virus et diagnostic virologique. Paris, Maloine Éditeur, 1983, 997p.
  • Thierry Borrel : Les Virus. Diversité et organisation du monde viral. Interactions avec le vivant. Nathan Université, Paris, 1996.
  • Gessain A., Manuguerra J.C. : Les virus émergents. Collection « Que sais-je ? », Presses Universitaires de France, 2006.

Sites internet

Références par zone géographiques

Europe

Bibliographie

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Moyen-Orient - Asie

Bibliographie

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Afrique

Bibliographie

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Amérique du Nord

Bibliographie

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Amérique centrale et du Sud

Bibliographie

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Régions polaires

Bibliographie

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Écologie microbienne générale

Bibliographie

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Eaux douces

Bibliographie

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Milieu océanique

Bibliographie

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Plancton

Bibliographie

  • C. S. Reynolds, 2006. The Ecology of Phytoplankton (Ecology, Biodiversity and Conservation). Cambridge University Press (May 29, 2006), 550 pp. ISBN 0521605199; ISBN 978-0521605199.
  • Tomas, C. (ed.), 1997, Identifying Marine Phytoplankton,, Academic Press, San Diego
  • Horner, R.A., 2002, A taxonomic guide to some common marine phytoplankton, Biopress limited

Sites internet

Extrêmophiles

Bibliographie

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Sites internet

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