L'acide chloraurique est utilisé comme électrolyte dans le procédé Wohlwill de raffinage de l'or.
Comme le sel le plus commun de l'or, le chlorure d'or(III), il a de nombreuses applications de niche et est largement étudié dans la recherche. Il est par exemple, assez rarement, utilisé pour déposer des particules d'or sous la peau dans l'art corporel. Il est aussi utilisé en photographie comme bain de virage, pour donner une teinte dorée à la photo.
L'or colloïdal et les nanoparticules d'or sont produites en général dans une solution (« méthodes chimiques liquides ») par réduction de l'acide chloraurique par le sulfure de sodium, bien que des méthodes alternatives existent, comme la réaction de Norrish.