Ce centre unique en son genre a fonctionné de 1966 à 1976. Il a réuni entre 300 et 400 personnes (étudiants et enseignants). La base de son activité se passait autour des cours d'espagnol.
Le CIDOC ne fonctionnait pas comme une université d'été, car pour Illich l'apprentissage ne peut se faire que dans une totale liberté. En pratique, des petites annonces paraissaient dans des grands journaux américains, avec les thèmes proposés pour un semestre. Les intéressés – à titre d'étudiant ou d'enseignant – s'annonçaient au registrar du CIDOC (les enseignants indiquant leur sujet, leurs objectifs et leur parcours). C'était donner beaucoup de responsabilité dans un contexte où tous étaient habitués à « consommer » de l'enseignement. Aucune liste de présence ou attestation, aucun examen ou mémoire écrit. La majorité des étudiants appartenaient à la génération du « baby boom », qui s'opposaient à la culture de consommation de masse de leurs parents. Ils se retrouvaient à Berkeley, Haight-Ashbury (San Francisco), Palo Alto et Esalen, aussi bien qu'au CIDOC.
Les cours donnés hebdomadairement par Illich l'étaient alternativement en anglais et en espagnol. Les périodiques CIDOC Cuadernos, CIDOC Dossier et CIDOC Sondeos ont questionné le changement social en Amérique latine. Illich a publié une soixantaine de numéros par année, avec une diffusion de 200 à 300 exemplaires par numéro.
Martina Kaller-Dietrich résume ainsi : « Le CIDOC était un lieu de rencontre pour humanistes souhaitant découvrir les conséquences des changements sociaux et idéologiques sur l'esprit et l'âme des gens, spécialement en Amérique latine », et cite ces propos de Illich : « It is a setting for understanding the implications of social revolution, not an instrument for promoting particular theories of social action. »
Après dix ans, Illich a lui-même décidé de mettre fin au CIDOC, convaincu que l'aura incomparable de ce lieu ne pourrait durer car les institutions « se défont ».