Évolutionnisme contre Créationnisme
Cette controverse est née de la parution, en 1859, de l'ouvrage de Charles Darwin L'Origine des espèces. Ce dernier prônait la thèse de l'Évolutionnisme contre celle établie du Créationnisme. Bien que virulent, le débat scientifique fut de courte durée, tant les preuves de l'évolutionnisme sont nombreuses et probantes. Ce débat est donc clos depuis longtemps, d'un point de vue scientifique ; mais oppose toujours science et religion (cf. Créationnisme).
Urbain Le Verrier contre John Couch Adams
Qui a découvert la planète Neptune ?
Julius Robert von Mayer contre James Prescott Joule
Les deux hommes revendiquent la paternité du principe de conservation de l'énergie (la première loi de la thermodynamique).
Louis Pasteur contre Félix-Archimède Pouchet
La génération spontanée, et l'abiogenèse, est une hypothèse selon laquelle la vie naît de l'inanimé. Les êtres vivants se formeraient spontanément à partir de la matière inerte. Cette transformation serait rendue possible grâce à un « principe actif » qui permet à la matière inanimée de devenir vivante. Tout commença lorsque le médecin et chimiste belge Jean-Baptiste van Helmont (1577-1644) décrivit une méthode étonnante pour obtenir des souris. Il suffisait de placer dans une caisse des grains de blé avec une chemise sale, pour qu'après 21 jours naquissent des souris. Selon lui, c'était la sueur humaine de la chemise qui constituait le « principe actif », essentiel au processus. Ensuite, il continua ses expérimentations avec, cette fois-ci, un saule. Il tira de cette expérience la conclusion que toute substance vivante de l'arbre venait de l'eau.
La biogenèse, démontre que la vie ne provient que de la vie. C'est-à-dire que les être vivants proviennent d'êtres préexistants. Cependant, cette théorie fut l'objet d'une controverse qui s'échelonna sur quelque 200 ans, une des plus longues controverses de l'histoire des sciences. Tout commença lorsque Francesco Redi, naturaliste italien, effectua une expérience, la première d'une série de trois, sur la véracité des expériences pour la génération spontanée. Il déposa une série de pots, donc chacun contenait du serpent, du poisson, de l'anguille ou du veau de lait. Il les laissa ouverts pendant quelques jours, et au bout de ces quelques jours, remarqua que les pots laissés à découvert contenaient un essaim de mouches et que les morceaux de viande étaient recouverts de larves. Il effectua ensuite la même expérience, en changeant toutefois une seule petite chose, il scella les pots. Après le même délai, il regarda les pots et ils ne laissaient voir aucune trace de larve, même après plusieurs semaines. Ils ne contenaient rien d'autre que de la viande putréfiée. Ayant subi beaucoup de critiques, il recommença son expérience, mais en laissant passer l'air à l'aide d'une gaze fine. Après plusieurs semaines, il remarqua qu'aucune mouche n'y avait pénétré. Ce n'est pas pour autant que la communauté scientifique fut convaincue, car il demeurait de nombreux cas inexpliqués où des vers et des insectes semblaient provenir de nulle part. Pasteur quant à lui fit une expérience avec des flacons à col de cygne. Il prétendait que si on capturait les micro-organismes avant leur arrivée dans un bouillon stérilisé, ce dernier pouvait demeurer stérile pendant plus d'un an. C'est ainsi que Pasteur répondit à la question qui avait laissé dans le doute des milliers de personnes pendant près de 2 siècles, « la vie ne provient que de la vie. » !
Les réactions furent vives face à certaines découvertes faites par Louis Pasteur qui contredisaient la théorie de la génération spontanée (1854). Celle-ci fut l’objet de polémiques qui amenèrent Pasteur à confronter ses idées avec celles d’un autre chimiste : Félix-Archimède Pouchet. Cette controverse fut débattue devant l’Académie des sciences qui approuva Pasteur. Malgré cette décision, les débats se poursuivirent jusqu’en 1870. Il est à noter que Pouchet mourut en 1872, ce qui mit véritablement un terme aux débats.
Mais Pasteur ne prétendait pas répondre à la question suivante : d'où provient la première forme de vie ?
Holisme contre Réductionnisme
cf. la Controverse scientifique concernant la théorie holistique.