Les techniques de culture sont nombreuses ; elles varient en fonction :
- de la nature du prélèvement : surfaces, sécrétions, selles, organes, ...
- des buts de l'étude : identification, dénombrement, ...
- de la précision attendue : dans le cas de bactéries pathogènes par exemple,
- des moyens à disposition du chercheur : matériel, temps, ...
Parmi les techniques fréquemment employées, on trouve l'ensemencement d'une souche en boîte de Pétri, tube à essai, ou galerie :
Il s'agit de placer des bactéries à la surface ou à l'intérieur d'une gélose.
Les géloses contiennent des éléments nécessaires à la croissance bactérienne, mais aussi, parfois, des produits inhibiteurs.
On place les cultures microbiennes à une température favorable (en général 37°C) pendant environ une journée (24 heures).