L'ectoderme (ou ectoblaste), par opposition à l'endoderme et au mésoderme, est le feuillet externe de l'embryon des métazoaires qui se met en place au moment de la gastrulation. Il a généralement pour rôle de donner naissance aux organes externes, aux muqueuses, mais également au système nerveux: ainsi, chez les mammifères, l'ectoderme donne naissance à la peau, à la cornée des yeux, à l'émail des dents, au rectum, au tube digestif (de la bouche à l'anus), à l'appareil respiratoire, aux appareils uro-génitales et aux nerfs.