Frascati prit son nom de « frasche » ou broussailles dont les ruines des villas de Lucullus Galba et de Domitien étaient généralement couvertes. Primitivement, Frascati était le principal faubourg de Tusculum, et contenait plusieurs villas impériales avec leurs dépendances, aussi l'histoire de ces deux villes peut difficilement être séparées. Frascati était déjà un grand village agricole quand, en 1191 Tusculum fut détruite. Elle possédait alors deux églises: Santa Maria in Vivario et Saint Sébastien. Plusieurs réfugiés s'établirent à Frascati, qui était sous la protection des Papes.
Depuis le XIV siècle les Papes ont toujours montré une prédilection pour Frascati. Ils y ont fait construire de superbes villas, toutes plus belles les unes que les autres. L'ancien chateau de Frascati fut donné par le Pape Martin V à la famille Colonna ; plus tard, il devint la résidence d'été de Pie II; puis il fut vendu (le 14 octobre 1478) au cardinal d'Estouteville, et enfin le Pape Alexandre VI le donna à Lucrèce Borgia. En 1538, le Pape Paul III Farnese dècréta que Frascati serait une cité sous le nom de « Tusculum Novum. »
En 1848, le Pape Pie IX décida qu'un chemin de fer, le premier des États Romains, serait établi entre Rome et Frascati ; il ne fut terminé et inauguré qu'en 1856.