Le point de départ du logiciel Paint.NET est un projet en informatique durant le primptemps 2004 à l'université de l'état de Washington. Rick Brewster, l'un des principaux participants, affirme que le version 1.0 fut écrite en 15 semaines et faisait 36 000 lignes de code. La dernière version (actuellement la version 2.72) fait approximativement 105 000 lignes de code. Le projet Paint.NET continua durant l'été et l'automne 2004 pour les versions 1.1 et 2.0.
Le développement actuel continue avec deux développeurs travaillant pour Microsoft, ces derniers ayant déjà collaborés sur des versions du projet alors qu'ils étaient étudiants à l'université d'origine du projet. En mai 2006 le programme avait été téléchargé 2 millions de fois , à un taux d'environ 180 000 téléchargements par mois .
- Version 3.2 (Publiée le : 12 décembre, 2007)
- Version 3.1 (Publiée le : 23 août, 2007)
- Version 3.0 (Publiée le : 26 janvier, 2007)
- Interface utilisateur à onglets
- Palette de couleur définissable par l'utilisateur (contrairement à la simple roue de couleur)
- Dessin de dégradés
- Commande de fusion des calques
- Plus d'effets : Nuages, médiane, défocalistion, bordure, et une précision accrue
- Plus de support de Windows 2000
- Version 2.7 (Publiée le : 2 août, 2006) -- Ajout de 5 nouveaux effets
- v2.72 - ajout d'un effet et correction de bogues mineurs
- Version 2.6 (Publiée le : 24 février, 2006)
- Développeurs: Rick Brewster (chef de projet), Tom Jackson
- Traduction allemande: Dennis Dietrich
- v2.61 (Publiée le 29 mars, 2006) -- Corrections de bogues mineurs
- v2.62 (Publiée le 10 mai, 2006) -- Corrections de bogues mineurs
- v2.63 (Publiée le 4 juin, 2006) -- Corrections de bogues mineurs
- v2.64 (Publiée le 8 juillet, 2006 ) -- Corrections de bogues mineurs
- Version 2.5 (Publiée le 26 novembre, 2005):
- Développeurs: Rick Brewster (chef de projet), Tom Jackson
- Traduction allemande: Dennis Dietrich
- Version 2.1 (Publiée le 30 avril, 2005):
- Développeurs: Rick Brewster (chef de projet), Tom Jackson, Craig Taylor
- Conception artistique du site Web: Luke Walker
- Version 2.0 (Publiée le 17 décembre, 2004):
- Développeurs WSU : Tom Jackson, Michael Kelsey, Craig Taylor
- Conseiller WSU: Jack Hagemeister
- Guide Microsoft: Rick Brewster
- Effets Emboss, relief, détection de contour: Chris Crosetto
- Test: WSU's Computer Science 422 Fall 2004 Students
- Version 1.1 (Publiée le 1 octobre, 2004):
- Guide Microsoft, Developpeur principal: Rick Brewster
- Testeurs et documenteurs WSU : Tom Jackson, Michael Kelsey, Craig Taylor
- Version 1.0 (publiée le 6 mai, 2004):
- Développeurs WSU: Rick Brewster, Brandon Ortiz, Chris Trevino, Luke Walker
- Conseiller WSU: Jack Hagemeister
- Parrain Microsoft: Ivan Lumala
- Guide Microsoft: Kerry Hammil