Philippe Marchesin est un spécialiste des relations Nord-Sud, tout particulièrement des questions de coopération et de développement. L'originalité de son approche est de mêler réflexion théorique et longs séjours de terrain. Il a ainsi enseigné pendant une dizaine d'années en Mauritanie (ENA et faculté de droit de Nouakchott), Turquie (Université de Galatasaray) et Biélorussie (faculté franco-biélorusse de science politique).
Ses travaux les plus marquants ont porté sur la sécurité alimentaire, le fait tribal en Mauritanie, la coopération française, la Biélorussie et les relations Nord-Sud. Il a été membre du comité directeur du GEMDEV (Groupement pour l'étude de la mondialisation et du développement), président de l'Observatoire permanent de la coopération française, directeur du diplôme d'études supérieures spécialisées Développement et coopération à l'université de Paris 1, responsable de l'option science politique du diplôme d'études approfondies Etudes africaines à l'université de Paris 1 et co-doyen de la faculté franco-biélorusse de science politique. Philippe Marchesin s'efforce actuellement de poursuivre son travail d'analyse des relations Nord-Sud tout en posant les jalons d'une étude comparative du développement qui s'appuie sur l'observation d'aires culturelles différentes.