Il est généralement composé de deux éléments en verre s'assemblant précisément par un joint en verre rodé :
- une fiole (classiquement d'une capacité de 50 cm) ;
- un bouchon percé d'un tube très fin (capillaire).
On trouve aussi l'appellation « pycnomètre à bouchon capillaire ».
Lorsque l'on ajuste le bouchon sur la fiole, le trop-plein de liquide s'échappe par l'extrémité supérieure du tube et, dans la mesure où ce tube est très fin, le volume de liquide est déterminé avec une grande précision.
La capacité du pycnomètre propre étant connue avec précision (indiquée par le fabricant ou mesurée par étalonnage), il suffit de peser au moyen d'une balance de précision le pycnomètre avant et après remplissage pour déterminer par calcul la masse volumique d'un produit liquide, ou éventuellement solide.